]> git.unchartedbackwaters.co.uk Git - francis/stp.git/commitdiff
added cryptominisat. the second time
authorvijay_ganesh <vijay_ganesh@e59a4935-1847-0410-ae03-e826735625c1>
Thu, 29 Oct 2009 17:54:48 +0000 (17:54 +0000)
committervijay_ganesh <vijay_ganesh@e59a4935-1847-0410-ae03-e826735625c1>
Thu, 29 Oct 2009 17:54:48 +0000 (17:54 +0000)
git-svn-id: https://stp-fast-prover.svn.sourceforge.net/svnroot/stp-fast-prover/trunk/stp@360 e59a4935-1847-0410-ae03-e826735625c1

22 files changed:
src/sat/cryptominisat/AUTHORS [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/LICENSE [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/Logger.C [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/Logger.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/MTRand/MersenneTwister.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/Makefile [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/Solver.C [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/Solver.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/SolverTypes.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/clause.cpp [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/clause.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/fcopy.cpp [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/fcopy.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Alg.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/BasicHeap.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/BoxedVec.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Heap.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Map.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Queue.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Sort.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/Vec.h [new file with mode: 0644]
src/sat/cryptominisat/mtl/template.mk [new file with mode: 0644]

diff --git a/src/sat/cryptominisat/AUTHORS b/src/sat/cryptominisat/AUTHORS
new file mode 100644 (file)
index 0000000..98599fa
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,10 @@
+Niklas Eén
+Niklas Sörensson
+Mate SOOS <mate.soos@inrialpes.fr>
+Karsten Nohl <honk98@web.de>
+
+thanks to:
+- the authors' professors for their trust in their PhD students' capabilities
+- the gcc compiler team for the excellent C++ compiler
+- libstdc team for the excellent standard library
+- Bjarne Stroustrup for the excellent C++
diff --git a/src/sat/cryptominisat/LICENSE b/src/sat/cryptominisat/LICENSE
new file mode 100644 (file)
index 0000000..beb0799
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,21 @@
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a
+copy of this software and associated documentation files (the
+"Software"), to deal in the Software without restriction, including
+without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish,
+distribute, sublicense, and/or sell copies of the Software, and to
+permit persons to whom the Software is furnished to do so, subject to
+the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included
+in all copies or substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS
+OR IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF
+MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE
+LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION
+OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT OF OR IN CONNECTION
+WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
diff --git a/src/sat/cryptominisat/Logger.C b/src/sat/cryptominisat/Logger.C
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2bb52d0
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,748 @@
+/***********************************************************************************
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+#include <time.h>
+#include <cstring>
+#include <algorithm>
+#include <vector>
+#include <iostream>
+#include <iomanip>
+#include <fstream>
+#include <sstream>
+using std::cout;
+using std::endl;
+using std::ofstream;
+
+#include "Logger.h"
+#include "fcopy.h"
+#include "SolverTypes.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+#define MAX_VAR 1000000
+
+#define FST_WIDTH 10
+#define SND_WIDTH 35
+#define TRD_WIDTH 10
+
+Logger::Logger(int& _verbosity) :
+        proof_graph_on(false),
+        statistics_on(false),
+
+        max_print_lines(20),
+        uniqueid(1),
+        level(0),
+        begin_level(0),
+        max_group(0),
+
+        proof(NULL),
+        proof_num(0),
+
+        sum_conflict_depths(0),
+        no_conflicts(0),
+        no_decisions(0),
+        no_propagations(0),
+        sum_decisions_on_branches(0),
+        sum_propagations_on_branches(0),
+
+        verbosity(_verbosity)
+{
+    runid /= 10;
+    runid=time(NULL)%10000;
+    if (verbosity >= 1) printf("RunID is: #%d\n",runid);
+
+    sprintf(filename0,"proofs/%d-proof0.dot", runid);
+}
+
+// Adds a new variable to the knowledge of the logger
+void Logger::new_var(const Var var)
+{
+    assert(var < MAX_VAR);
+
+    if (varnames.size() <= var) {
+        varnames.resize(var+1);
+        times_var_propagated.resize(var+1);
+        times_var_guessed.resize(var+1);
+        depths_of_assigns_for_var.resize(var+1);
+    }
+}
+
+// Resizes the groupnames and other, related vectors to accomodate for a new group
+void Logger::new_group(const uint group)
+{
+    if (groupnames.size() <= group) {
+        uint old_size = times_group_caused_propagation.size();
+        groupnames.resize(group+1, "Noname");
+        times_group_caused_conflict.resize(group+1);
+        times_group_caused_propagation.resize(group+1);
+        depths_of_propagations_for_group.resize(group+1);
+        depths_of_conflicts_for_group.resize(group+1);
+        for (uint i = old_size; i < times_group_caused_propagation.size(); i++) {
+            times_group_caused_propagation[i] = 0;
+            times_group_caused_conflict[i] = 0;
+        }
+    }
+
+    max_group = std::max(group, max_group);
+}
+
+// Adds the new clause group's name to the information stored
+void Logger::set_group_name(const uint group, const char* name)
+{
+    new_group(group);
+
+    if (strlen(name) > SND_WIDTH-2) {
+        cout << "A clause group name cannot have more than " << SND_WIDTH-2 << " number of characters. You gave '" << name << "', which is " << strlen(name) << " long." << endl;
+        exit(-1);
+    }
+    
+    if (groupnames[group].empty() || groupnames[group] == "Noname") {
+        groupnames[group] = name;
+    } else if (name != '\0' && groupnames[group] != name) {
+        printf("Error! Group no. %d has been named twice. First, as '%s', then second as '%s'. Name the same group the same always, or don't give a name to the second iteration of the same group (i.e just write 'c g groupnumber' on the line\n", group, groupnames[group].c_str(), name);
+        exit(-1);
+    }
+}
+
+// sets the variable's name
+void Logger::set_variable_name(const uint var, const char* name)
+{
+    if (!proof_graph_on && !statistics_on) return;
+    
+    if (strlen(name) > SND_WIDTH-2) {
+        cout << "A variable name cannot have more than " << SND_WIDTH-2 << " number of characters. You gave '" << name << "', which is " << strlen(name) << " long." << endl;
+        exit(-1);
+    }
+
+    new_var(var);
+    varnames[var] = name;
+}
+
+void Logger::begin()
+{
+    char filename[80];
+    sprintf(filename, "proofs/%d-proof%d.dot", runid, proof_num);
+
+    if (proof_num > 0) {
+        if (proof_graph_on) {
+            FileCopy(filename0, filename);
+            proof = fopen(filename,"a");
+            if (!proof) printf("Couldn't open proof file '%s' for writing\n", filename), exit(-1);
+        }
+    } else {
+        history.growTo(10);
+        history[level] = uniqueid;
+
+        if (proof_graph_on) {
+            proof = fopen(filename,"w");
+            if (!proof) printf("Couldn't open proof file '%s' for writing\n", filename), exit(-1);
+            fprintf(proof, "digraph G {\n");
+            fprintf(proof,"node%d [shape=circle, label=\"BEGIN\", root];\n", uniqueid);
+        }
+    }
+
+    if (statistics_on)
+        reset_statistics();
+
+    level = begin_level;
+}
+
+// For noting conflicts. Updates the proof graph and the statistics.
+void Logger::conflict(const confl_type type, uint goback, const uint group, const vec<Lit>& learnt_clause)
+{
+    assert(!(proof == NULL && proof_graph_on));
+    assert(goback < level);
+
+    goback += begin_level;
+    uniqueid++;
+
+    if (proof_graph_on) {
+        fprintf(proof,"node%d [shape=polygon,sides=5,label=\"",uniqueid);
+        for (int i = 0; i < learnt_clause.size(); i++) {
+            if (learnt_clause[i].sign()) fprintf(proof,"-");
+            int myvar = learnt_clause[i].var();
+            if (varnames.size() <= myvar || varnames[myvar].empty())
+                fprintf(proof,"%d\\n",myvar+1);
+            else fprintf(proof,"%s\\n",varnames[myvar].c_str());
+        }
+
+        fprintf(proof,"\"];\n");
+
+        fprintf(proof,"node%d -> node%d [label=\"",history[level],uniqueid);
+
+        if (type == gauss_confl_type) {
+            fprintf(proof,"Gauss\",style=bold");
+        } else if (group > max_group) fprintf(proof,"**%d\"",group);
+        else {
+            if (groupnames.size() <= group || groupnames[group].empty())
+                fprintf(proof,"%d\"", group);
+            else fprintf(proof,"%s\"", groupnames[group].c_str());
+        }
+
+        fprintf(proof,"];\n");
+        fprintf(proof,"node%d -> node%d [style=bold];\n",uniqueid,history[goback]);
+    }
+
+    if (statistics_on) {
+        const uint depth = level - begin_level;
+
+        if (group < max_group) { //TODO make work for learnt clauses
+            times_group_caused_conflict[group]++;
+            depths_of_conflicts_for_group[group].push_back(depth);
+        }
+        no_conflicts++;
+        sum_conflict_depths += depth;
+        sum_decisions_on_branches += decisions[depth];
+        sum_propagations_on_branches += propagations[depth];
+        branch_depth_distrib[depth]++;
+    }
+
+    level = goback;
+}
+
+// For the really strange event that the solver is given an empty clause
+void Logger::empty_clause(const uint group)
+{
+    assert(!(proof == NULL && proof_graph_on));
+
+    if (proof_graph_on) {
+        fprintf(proof,"node%d -> node%d [label=\"emtpy clause:",history[level],uniqueid+1);
+        if (group > max_group) fprintf(proof,"**%d\\n",group);
+        else {
+            if (groupnames.size() <= group || groupnames[group].empty())
+                fprintf(proof,"%d\\n", group);
+            else fprintf(proof,"%s\\n", groupnames[group].c_str());
+        }
+
+        fprintf(proof,"\"];\n");
+    }
+}
+
+// Propagating a literal. Type of literal and the (learned clause's)/(propagating clause's)/(etc) group must be given. Updates the proof graph and the statistics. note: the meaning of the variable 'group' depends on the type
+void Logger::propagation(const Lit lit, const prop_type type, const uint group)
+{
+    assert(!(proof == NULL && proof_graph_on));
+    uniqueid++;
+
+    //graph
+    if (proof_graph_on) {
+        fprintf(proof,"node%d [shape=box, label=\"",uniqueid);;
+        if (lit.sign()) fprintf(proof,"-");
+        if (varnames.size() <= lit.var() || varnames[lit.var()].empty())
+            fprintf(proof,"%d\"];\n",lit.var()+1);
+        else fprintf(proof,"%s\"];\n",varnames[lit.var()].c_str());
+
+        fprintf(proof,"node%d -> node%d [label=\"",history[level],uniqueid);
+        switch (type) {
+
+        case revert_guess_type:
+        case simple_propagation_type:
+            assert(group != UINT_MAX);
+            if (group > max_group) fprintf(proof,"**%d\\n",group);
+            else {
+                if (groupnames.size() <= group || groupnames[group].empty())
+                    fprintf(proof,"%d\\n", group);
+                else fprintf(proof,"%s\\n", groupnames[group].c_str());
+            }
+
+            fprintf(proof,"\"];\n");
+            break;
+
+        case gauss_propagation_type:
+            fprintf(proof,"Gauss\",style=bold];\n");
+            break;
+
+        case learnt_unit_clause_type:
+            fprintf(proof,"learnt unit clause\",style=bold];\n");
+            break;
+
+        case assumption_type:
+            fprintf(proof,"assumption\"];\n");
+            break;
+
+        case guess_type:
+            fprintf(proof,"guess\",style=dotted];\n");
+            break;
+
+        case addclause_type:
+            assert(group != UINT_MAX);
+            if (groupnames.size() <= group || groupnames[group].empty())
+                fprintf(proof,"red. from %d\"];\n",group);
+            else fprintf(proof,"red. from %s\"];\n",groupnames[group].c_str());
+            break;
+        }
+    }
+
+    if (statistics_on && proof_num > 0) switch (type) {
+        case gauss_propagation_type:
+        case simple_propagation_type:
+            no_propagations++;
+            times_var_propagated[lit.var()]++;
+            if (group < max_group) { //TODO make work for learnt clauses
+                depths_of_propagations_for_group[group].push_back(level - begin_level);
+                times_group_caused_propagation[group]++;
+            }
+            depths_of_assigns_for_var[lit.var()].push_back(level - begin_level);
+            break;
+
+        case learnt_unit_clause_type: //when learning unit clause
+        case revert_guess_type: //when, after conflict, a guess gets reverted
+            if (group < max_group) { //TODO make work for learnt clauses
+                times_group_caused_propagation[group]++;
+                depths_of_propagations_for_group[group].push_back(level - begin_level);
+            }
+            depths_of_assigns_for_var[lit.var()].push_back(level - begin_level);
+        case guess_type:
+            times_var_guessed[lit.var()]++;
+            depths_of_assigns_for_var[lit.var()].push_back(level - begin_level);
+            no_decisions++;
+            break;
+
+        case addclause_type:
+        case assumption_type:
+            assert(false);
+        }
+
+    level++;
+
+    if (proof_num > 0) {
+        decisions.growTo(level-begin_level+1);
+        propagations.growTo(level-begin_level+1);
+        if (level-begin_level == 1) {
+            decisions[0] = 0;
+            propagations[0] = 0;
+            //note: we might reach this place TWICE in the same restart. This is because the first assignement might get reverted
+        }
+        if (type == simple_propagation_type) {
+            decisions[level-begin_level] = decisions[level-begin_level-1];
+            propagations[level-begin_level] = propagations[level-begin_level-1]+1;
+        } else {
+            decisions[level-begin_level] = decisions[level-begin_level-1]+1;
+            propagations[level-begin_level] = propagations[level-begin_level-1];
+        }
+    }
+
+    if (history.size() < level+1) history.growTo(level+10);
+    history[level] = uniqueid;
+}
+
+// Ending of a restart iteration. Also called when ending S.simplify();
+void Logger::end(const finish_type finish)
+{
+    assert(!(proof == NULL && proof_graph_on));
+
+    switch (finish) {
+    case model_found: {
+        uniqueid++;
+        if (proof_graph_on) fprintf(proof,"node%d [shape=doublecircle, label=\"MODEL\"];\n",uniqueid);
+        break;
+    }
+    case unsat_model_found: {
+        uniqueid++;
+        if (proof_graph_on) fprintf(proof,"node%d [shape=doublecircle, label=\"UNSAT\"];\n",uniqueid);
+        break;
+    }
+    case restarting: {
+        uniqueid++;
+        if (proof_graph_on) fprintf(proof,"node%d [shape=doublecircle, label=\"Re-starting\\nsearch\"];\n",uniqueid);
+        break;
+    }
+    case done_adding_clauses: {
+        begin_level = level;
+        break;
+    }
+    }
+
+    if (proof_graph_on) {
+        if (proof_num > 0) {
+            fprintf(proof,"node%d -> node%d;\n",history[level],uniqueid);
+            fprintf(proof,"}\n");
+        } else proof0_lastid = uniqueid;
+
+        proof = (FILE*)fclose(proof);
+        assert(proof == NULL);
+
+        if (finish == model_found || finish == unsat_model_found) {
+            proof = fopen(filename0,"a");
+            fprintf(proof,"node%d [shape=doublecircle, label=\"Done adding\\nclauses\"];\n",proof0_lastid+1);
+            fprintf(proof,"node%d -> node%d;\n",proof0_lastid,proof0_lastid+1);
+            fprintf(proof,"}\n");
+            proof = (FILE*)fclose(proof);
+            assert(proof == NULL);
+        }
+    }
+
+    if (statistics_on) printstats();
+
+    proof_num++;
+}
+
+void Logger::print_footer() const
+{
+    cout << "+" << std::setfill('-') << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+TRD_WIDTH+4) << "-" << std::setfill(' ') << "+" << endl;
+}
+
+void Logger::print_assign_var_order() const
+{
+    vector<pair<double, uint> > prop_ordered;
+    for (uint i = 0; i < depths_of_assigns_for_var.size(); i++) {
+        double avg = 0.0;
+        for (vector<uint>::const_iterator it = depths_of_assigns_for_var[i].begin(); it != depths_of_assigns_for_var[i].end(); it++)
+            avg += *it;
+        if (depths_of_assigns_for_var[i].size() > 0) {
+            avg /= (double) depths_of_assigns_for_var[i].size();
+            prop_ordered.push_back(std::make_pair(avg, i));
+        }
+    }
+
+    if (!prop_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" Variables are assigned in the following order");
+        print_header("var", "var name", "avg order");
+        std::sort(prop_ordered.begin(), prop_ordered.end());
+        print_vars(prop_ordered);
+    }
+}
+
+void Logger::print_prop_order() const
+{
+    vector<pair<double, uint> > prop_ordered;
+    for (uint i = 0; i < depths_of_propagations_for_group.size(); i++) {
+        double avg = 0.0;
+        for (vector<uint>::const_iterator it = depths_of_propagations_for_group[i].begin(); it != depths_of_propagations_for_group[i].end(); it++)
+            avg += *it;
+        if (depths_of_propagations_for_group[i].size() > 0) {
+            avg /= (double) depths_of_propagations_for_group[i].size();
+            prop_ordered.push_back(std::make_pair(avg, i));
+        }
+    }
+
+    if (!prop_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" Propagation depth order of clause groups");
+        print_header("group", "group name", "avg order");
+        std::sort(prop_ordered.begin(), prop_ordered.end());
+        print_groups(prop_ordered);
+    }
+}
+
+void Logger::print_confl_order() const
+{
+    vector<pair<double, uint> > confl_ordered;
+    for (uint i = 0; i < depths_of_conflicts_for_group.size(); i++) {
+        double avg = 0.0;
+        for (vector<uint>::const_iterator it = depths_of_conflicts_for_group[i].begin(); it != depths_of_conflicts_for_group[i].end(); it++)
+            avg += *it;
+        if (depths_of_conflicts_for_group[i].size() > 0) {
+            avg /= (double) depths_of_conflicts_for_group[i].size();
+            confl_ordered.push_back(std::make_pair(avg, i));
+        }
+    }
+
+    if (!confl_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" Avg. conflict depth order of clause groups");
+        print_header("groupno", "group name", "avg. depth");
+        std::sort(confl_ordered.begin(), confl_ordered.end());
+        print_groups(confl_ordered);
+    }
+}
+
+
+void Logger::print_times_var_guessed() const
+{
+    vector<pair<uint, uint> > times_var_ordered;
+    for (int i = 0; i < varnames.size(); i++) if (times_var_guessed[i] > 0)
+            times_var_ordered.push_back(std::make_pair(times_var_guessed[i], i));
+
+    if (!times_var_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" No. times variable branched on");
+        print_header("var", "var name", "no. times");
+        std::sort(times_var_ordered.rbegin(), times_var_ordered.rend());
+        print_vars(times_var_ordered);
+    }
+}
+
+void Logger::print_times_group_caused_propagation() const
+{
+    vector<pair<uint, uint> > props_group_ordered;
+    for (uint i = 0; i < times_group_caused_propagation.size(); i++)
+        if (times_group_caused_propagation[i] > 0)
+            props_group_ordered.push_back(std::make_pair(times_group_caused_propagation[i], i));
+
+    if (!props_group_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" No. propagations made by clause groups");
+        print_header("group", "group name", "no. props");
+        std::sort(props_group_ordered.rbegin(),props_group_ordered.rend());
+        print_groups(props_group_ordered);
+    }
+}
+
+void Logger::print_times_group_caused_conflict() const
+{
+    vector<pair<uint, uint> > confls_group_ordered;
+    for (uint i = 0; i < times_group_caused_conflict.size(); i++)
+        if (times_group_caused_conflict[i] > 0)
+            confls_group_ordered.push_back(std::make_pair(times_group_caused_conflict[i], i));
+
+    if (!confls_group_ordered.empty()) {
+        print_footer();
+        print_simple_line(" No. conflicts made by clause groups");
+        print_header("group", "group name", "no. confl");
+        std::sort(confls_group_ordered.rbegin(), confls_group_ordered.rend());
+        print_groups(confls_group_ordered);
+    }
+}
+
+template<class T>
+inline void Logger::print_line(const uint& number, const string& name, const T& value) const
+{
+    cout << "|" << std::setw(FST_WIDTH) << number << "  " << std::setw(SND_WIDTH) << name << "  " << std::setw(TRD_WIDTH) << value << "|" << endl;
+}
+
+void Logger::print_header(const string& first, const string& second, const string& third) const
+{
+    cout << "|" << std::setw(FST_WIDTH) << first << "  " << std::setw(SND_WIDTH) << second << "  " << std::setw(TRD_WIDTH) << third << "|" << endl;
+    print_footer();
+}
+
+void Logger::print_groups(const vector<pair<double, uint> >& to_print) const
+{
+    uint i = 0;
+    typedef vector<pair<double, uint> >::const_iterator myiterator;
+    for (myiterator it = to_print.begin(); it != to_print.end() && i < max_print_lines; it++, i++) {
+        string name;
+        
+        if (it->second > max_group)
+            name = "learnt clause";
+        else
+            name = groupnames[it->second];
+        
+        print_line(it->second+1, name, it->first);
+    }
+    print_footer();
+}
+
+void Logger::print_groups(const vector<pair<uint, uint> >& to_print) const
+{
+    uint i = 0;
+    typedef vector<pair<uint, uint> >::const_iterator myiterator;
+    for (myiterator it = to_print.begin(); it != to_print.end() && i < max_print_lines; it++, i++) {
+        string name;
+        
+        if (it->second > max_group)
+            name = "learnt clause";
+        else
+            name = groupnames[it->second];
+        
+        print_line(it->second+1, name, it->first);
+    }
+    print_footer();
+}
+
+void Logger::print_vars(const vector<pair<double, uint> >& to_print) const
+{
+    uint i = 0;
+    for (vector<pair<double, uint> >::const_iterator it = to_print.begin(); it != to_print.end() && i < max_print_lines; it++, i++)
+        print_line(it->second+1, varnames[it->second], it->first);
+    
+    print_footer();
+}
+
+void Logger::print_vars(const vector<pair<uint, uint> >& to_print) const
+{
+    uint i = 0;
+    for (vector<pair<uint, uint> >::const_iterator it = to_print.begin(); it != to_print.end() && i < max_print_lines; it++, i++) {
+        print_line(it->second+1, varnames[it->second], it->first);
+    }
+    
+    print_footer();
+}
+
+template<class T>
+void Logger::print_line(const string& str, const T& num) const
+{
+    cout << "|" << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+4) << str << std::setw(TRD_WIDTH) << num << "|" << endl;
+}
+
+void Logger::print_simple_line(const string& str) const
+{
+    cout << "|" << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+TRD_WIDTH+4) << str << "|" << endl;
+}
+
+void Logger::print_branch_depth_distrib() const
+{
+    //cout << "--- Branch depth stats ---" << endl;
+
+    const uint range = 20;
+    map<uint, uint> range_stat;
+
+    for (map<uint, uint>::const_iterator it = branch_depth_distrib.begin(); it != branch_depth_distrib.end(); it++) {
+        //cout << it->first << " : " << it->second << endl;
+        range_stat[it->first/range] += it->second;
+    }
+    //cout << endl;
+
+    print_footer();
+    print_simple_line(" No. search branches with branch depth between");
+    print_line("Branch depth between", "no. br.-s");
+    print_footer();
+
+    std::stringstream ss;
+    ss << "branch_depths/branch_depth_file" << runid << "-" << proof_num << ".txt";
+    ofstream branch_depth_file;
+    branch_depth_file.open(ss.str().c_str());
+    uint i = 0;
+    
+    for (map<uint, uint>::iterator it = range_stat.begin(); it != range_stat.end(); it++) {
+        std::stringstream ss2;
+        ss2 << it->first*range << " - " << it->first*range + range-1;
+        print_line(ss2.str(), it->second);
+
+        if (branch_depth_file.is_open()) {
+                branch_depth_file << i << "\t" << it->second << "\t";
+            if (i %  5 == 0)
+                branch_depth_file  << "\"" << it->first*range << "\"";
+            else
+                branch_depth_file << "\"\"";
+            branch_depth_file << endl;
+        }
+        i++;
+    }
+    if (branch_depth_file.is_open())
+        branch_depth_file.close();
+    print_footer();
+
+}
+
+void Logger::print_general_stats(uint restarts, uint64_t conflicts, int vars, int noClauses, uint64_t clauses_Literals, int noLearnts, double litsPerLearntCl, double progressEstimate) const
+{
+    print_footer();
+    print_simple_line(" Standard MiniSat restart statistics");
+    print_footer();
+    print_line("Restart number", restarts);
+    print_line("Number of conflicts", conflicts);
+    print_line("Number of variables", vars);
+    print_line("Number of clauses", noClauses);
+    print_line("Number of literals in clauses",clauses_Literals);
+    print_line("Avg. literals per learnt clause",litsPerLearntCl);
+    print_line("Progress estimate (%):", progressEstimate);
+    print_footer();
+}
+
+
+// Prints statistics on the console
+void Logger::printstats() const
+{
+    assert(statistics_on);
+    assert(varnames.size() == times_var_guessed.size());
+    assert(varnames.size() == times_var_propagated.size());
+
+    printf("\n");
+    cout << "+" << std::setfill('=') << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+TRD_WIDTH+4) << "=" << "+" << endl;
+    cout << "||" << std::setfill('*') << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+TRD_WIDTH+2) << "********* STATS FOR THIS RESTART BEGIN " << "||" << endl;
+    cout << "+" << std::setfill('=') << std::setw(FST_WIDTH+SND_WIDTH+TRD_WIDTH+4) << "=" << std::setfill(' ') << "+" << endl;
+    cout.setf(std::ios_base::left);
+    cout.precision(4);
+    print_times_var_guessed();
+    print_times_group_caused_propagation();
+    print_times_group_caused_conflict();
+    print_prop_order();
+    print_confl_order();
+    print_assign_var_order();
+    print_branch_depth_distrib();
+
+    print_footer();
+    print_simple_line(" Advanced statistics");
+    print_footer();
+    print_line("No. branches visited", no_conflicts);
+    print_line("Avg. branch depth", (double)sum_conflict_depths/(double)no_conflicts);
+    print_line("No. decisions", no_decisions);
+    print_line("No. propagations",no_propagations);
+
+    //printf("no progatations/no decisions (i.e. one decision gives how many propagations on average *for the whole search graph*): %f\n", (double)no_propagations/(double)no_decisions);
+    //printf("no propagations/sum decisions on branches (if you look at one specific branch, what is the average number of propagations you will find?): %f\n", (double)no_propagations/(double)sum_decisions_on_branches);
+
+    print_simple_line("sum decisions on branches/no. branches");
+    print_simple_line(" (in a given branch, what is the avg.");
+    print_line("  no. of decisions?)",(double)sum_decisions_on_branches/(double)no_conflicts);
+
+    print_simple_line("sum propagations on branches/no. branches");
+    print_simple_line(" (in a given branch, what is the");
+    print_line("  avg. no. of propagations?)",(double)sum_propagations_on_branches/(double)no_conflicts);
+    print_footer();
+    
+    print_footer();
+    print_simple_line("Statistics note: If you used CryptoMiniSat as");
+    print_simple_line("a library then vars are all shifted by 1 here");
+    print_simple_line("and in every printed output of the solver.");
+    print_simple_line("This does not apply when you use CryptoMiniSat");
+    print_simple_line("as a stand-alone program.");
+    print_footer();
+}
+
+// resets all stored statistics. Might be useful, to generate statistics for each restart and not for the whole search in general
+void Logger::reset_statistics()
+{
+    assert(times_var_guessed.size() == times_var_propagated.size());
+    assert(times_group_caused_conflict.size() == times_group_caused_propagation.size());
+    
+    typedef vector<uint>::iterator vecit;
+    for (vecit it = times_var_guessed.begin(); it != times_var_guessed.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    for (vecit it = times_var_propagated.begin(); it != times_var_propagated.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    for (vecit it = times_group_caused_conflict.begin(); it != times_group_caused_conflict.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    for (vecit it = times_group_caused_propagation.begin(); it != times_group_caused_propagation.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    for (vecit it = confls_by_group.begin(); it != confls_by_group.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    for (vecit it = props_by_group.begin(); it != props_by_group.end(); it++)
+        *it = 0;
+
+    typedef vector<vector<uint> >::iterator vecvecit;
+
+    for (vecvecit it = depths_of_propagations_for_group.begin(); it != depths_of_propagations_for_group.end(); it++)
+        it->clear();
+
+    for (vecvecit it = depths_of_conflicts_for_group.begin(); it != depths_of_conflicts_for_group.end(); it++)
+        it->clear();
+
+    for (vecvecit it = depths_of_assigns_for_var.begin(); it != depths_of_assigns_for_var.end(); it++)
+        it->clear();
+
+    sum_conflict_depths = 0;
+    no_conflicts = 0;
+    no_decisions = 0;
+    no_propagations = 0;
+    decisions.clear();
+    propagations.clear();
+    sum_decisions_on_branches = 0;
+    sum_propagations_on_branches = 0;
+    branch_depth_distrib.clear();
+}
+};
diff --git a/src/sat/cryptominisat/Logger.h b/src/sat/cryptominisat/Logger.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..1fae9a7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,159 @@
+/***********************************************************************************
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef __LOGGER_H__
+#define __LOGGER_H__
+
+#include <stdio.h>
+#include <set>
+//#include <Vec.h>
+#include <vector>
+
+#include "mtl/Vec.h"
+#include "mtl/Heap.h"
+#include "mtl/Alg.h"
+#include "Logger.h"
+#include "SolverTypes.h"
+#include <string>
+#include <map>
+#include "stdint.h"
+#include "limits.h"
+
+using std::vector;
+using std::pair;
+using std::string;
+using std::map;
+
+
+namespace MINISAT
+{
+#ifndef uint
+#define uint unsigned int
+#endif
+
+class Logger
+{
+public:
+    Logger(int& vebosity);
+
+    //types of props, confl, and finish
+    enum prop_type { revert_guess_type, learnt_unit_clause_type, assumption_type, guess_type, addclause_type, simple_propagation_type, gauss_propagation_type };
+    enum confl_type { simple_confl_type, gauss_confl_type };
+    enum finish_type { model_found, unsat_model_found, restarting, done_adding_clauses };
+
+    //Conflict and propagation(guess is also a proapgation...)
+    void conflict(const confl_type type, uint goback, const uint group, const vec<Lit>& learnt_clause);
+    void propagation(const Lit lit, const prop_type type, const uint group = UINT_MAX);
+    void empty_clause(const uint group);
+
+    //functions to add/name variables
+    void new_var(const Var var);
+    void set_variable_name(const uint var, const char* name);
+
+    //functions to add/name clause groups
+    void new_group(const uint group);
+    void set_group_name(const uint group, const char* name);
+
+    void begin();
+    void end(const finish_type finish);
+    void print_general_stats(uint restarts, uint64_t conflicts, int vars, int noClauses, uint64_t clauses_Literals, int noLearnts, double litsPerLearntCl, double progressEstimate) const;
+
+    void newclause(const vec<Lit>& ps, const bool xor_clause, const uint group);
+
+    bool proof_graph_on;
+    bool statistics_on;
+private:
+    void print_groups(const vector<pair<uint, uint> >& to_print) const;
+    void print_groups(const vector<pair<double, uint> >& to_print) const;
+    void print_vars(const vector<pair<uint, uint> >& to_print) const;
+    void print_vars(const vector<pair<double, uint> >& to_print) const;
+    void print_times_var_guessed() const;
+    void print_times_group_caused_propagation() const;
+    void print_times_group_caused_conflict() const;
+    void print_branch_depth_distrib() const;
+
+    uint max_print_lines;
+    template<class T>
+    void print_line(const uint& number, const string& name, const T& value) const;
+    void print_header(const string& first, const string& second, const string& third) const;
+    void print_footer() const;
+    template<class T>
+    void print_line(const string& str, const T& num) const;
+    void print_simple_line(const string& str) const;
+    void print_confl_order() const;
+    void print_prop_order() const;
+    void print_assign_var_order() const;
+    void printstats() const;
+    void reset_statistics();
+
+    //internal data structures
+    uint uniqueid; //used to store the last unique ID given to a node
+    vec<uint> history; //stores the node uniqueIDs
+    uint level; //used to know the current level
+    uint begin_level;
+    uint max_group;
+
+    //graph drawing
+    FILE* proof; //The file to store the proof
+    uint proof_num;
+    char filename0[80];
+    uint runid;
+    uint proof0_lastid;
+
+    //---------------------
+    //statistics collection
+    //---------------------
+
+    //group and var names
+    vector<string> groupnames;
+    vector<string> varnames;
+
+    //confls and props grouped by clause groups
+    vector<uint> confls_by_group;
+    vector<uint> props_by_group;
+
+    //props and guesses grouped by vars
+    vector<uint> times_var_guessed;
+    vector<uint> times_var_propagated;
+
+    vector<uint> times_group_caused_conflict;
+    vector<uint> times_group_caused_propagation;
+
+    vector<vector<uint> > depths_of_propagations_for_group;
+    vector<vector<uint> > depths_of_conflicts_for_group;
+    vector<vector<uint> > depths_of_assigns_for_var;
+
+    //the distribution of branch depths. first = depth, second = number of occurances
+    map<uint, uint> branch_depth_distrib;
+
+    uint sum_conflict_depths;
+    uint no_conflicts;
+    uint no_decisions;
+    uint no_propagations;
+    vec<uint> decisions;
+    vec<uint> propagations;
+    uint sum_decisions_on_branches;
+    uint sum_propagations_on_branches;
+
+    //message display properties
+    const int& verbosity;
+};
+
+};
+#endif //__LOGGER_H__
diff --git a/src/sat/cryptominisat/MTRand/MersenneTwister.h b/src/sat/cryptominisat/MTRand/MersenneTwister.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..964ecc7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,427 @@
+// MersenneTwister.h
+// Mersenne Twister random number generator -- a C++ class MTRand
+// Based on code by Makoto Matsumoto, Takuji Nishimura, and Shawn Cokus
+// Richard J. Wagner  v1.0  15 May 2003  rjwagner@writeme.com
+
+// The Mersenne Twister is an algorithm for generating random numbers.  It
+// was designed with consideration of the flaws in various other generators.
+// The period, 2^19937-1, and the order of equidistribution, 623 dimensions,
+// are far greater.  The generator is also fast; it avoids multiplication and
+// division, and it benefits from caches and pipelines.  For more information
+// see the inventors' web page at http://www.math.keio.ac.jp/~matumoto/emt.html
+
+// Reference
+// M. Matsumoto and T. Nishimura, "Mersenne Twister: A 623-Dimensionally
+// Equidistributed Uniform Pseudo-Random Number Generator", ACM Transactions on
+// Modeling and Computer Simulation, Vol. 8, No. 1, January 1998, pp 3-30.
+
+// Copyright (C) 1997 - 2002, Makoto Matsumoto and Takuji Nishimura,
+// Copyright (C) 2000 - 2003, Richard J. Wagner
+// All rights reserved.                          
+//
+// Redistribution and use in source and binary forms, with or without
+// modification, are permitted provided that the following conditions
+// are met:
+//
+//   1. Redistributions of source code must retain the above copyright
+//      notice, this list of conditions and the following disclaimer.
+//
+//   2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
+//      notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
+//      documentation and/or other materials provided with the distribution.
+//
+//   3. The names of its contributors may not be used to endorse or promote 
+//      products derived from this software without specific prior written 
+//      permission.
+//
+// THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE COPYRIGHT HOLDERS AND CONTRIBUTORS
+// "AS IS" AND ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT
+// LIMITED TO, THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR
+// A PARTICULAR PURPOSE ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE COPYRIGHT OWNER OR
+// CONTRIBUTORS BE LIABLE FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL,
+// EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO,
+// PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR
+// PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION) HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF
+// LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT LIABILITY, OR TORT (INCLUDING
+// NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY OUT OF THE USE OF THIS
+// SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF SUCH DAMAGE.
+
+// The original code included the following notice:
+//
+//     When you use this, send an email to: matumoto@math.keio.ac.jp
+//     with an appropriate reference to your work.
+//
+// It would be nice to CC: rjwagner@writeme.com and Cokus@math.washington.edu
+// when you write.
+
+#ifndef MERSENNETWISTER_H
+#define MERSENNETWISTER_H
+
+#include <iostream>
+#include <limits.h>
+#include <stdio.h>
+#include <time.h>
+#include <math.h>
+
+namespace MINISAT
+{
+
+// Not thread safe (unless auto-initialization is avoided and each thread has
+// its own MTRand object)
+
+class MTRand {
+// Data
+public:
+       typedef unsigned long uint32;  // unsigned integer type, at least 32 bits
+       
+       enum { N = 624 };       // length of state vector
+       enum { SAVE = N + 1 };  // length of array for save()
+
+protected:
+       enum { M = 397 };  // period parameter
+       
+       uint32 state[N];   // internal state
+       uint32 *pNext;     // next value to get from state
+       int left;          // number of values left before reload needed
+
+
+//Methods
+public:
+       MTRand( const uint32& oneSeed );  // initialize with a simple uint32
+       MTRand( uint32 *const bigSeed, uint32 const seedLength = N );  // or an array
+       MTRand();  // auto-initialize with /dev/urandom or time() and clock()
+       
+       // Do NOT use for CRYPTOGRAPHY without securely hashing several returned
+       // values together, otherwise the generator state can be learned after
+       // reading 624 consecutive values.
+       
+       // Access to 32-bit random numbers
+       double rand();                          // real number in [0,1]
+       double rand( const double& n );         // real number in [0,n]
+       double randExc();                       // real number in [0,1)
+       double randExc( const double& n );      // real number in [0,n)
+       double randDblExc();                    // real number in (0,1)
+       double randDblExc( const double& n );   // real number in (0,n)
+       uint32 randInt();                       // integer in [0,2^32-1]
+       uint32 randInt( const uint32& n );      // integer in [0,n] for n < 2^32
+       double operator()() { return rand(); }  // same as rand()
+       
+       // Access to 53-bit random numbers (capacity of IEEE double precision)
+       double rand53();  // real number in [0,1)
+       
+       // Access to nonuniform random number distributions
+       double randNorm( const double& mean = 0.0, const double& variance = 0.0 );
+       
+       // Re-seeding functions with same behavior as initializers
+       void seed( const uint32 oneSeed );
+       void seed( uint32 *const bigSeed, const uint32 seedLength = N );
+       void seed();
+       
+       // Saving and loading generator state
+       void save( uint32* saveArray ) const;  // to array of size SAVE
+       void load( uint32 *const loadArray );  // from such array
+       friend std::ostream& operator<<( std::ostream& os, const MTRand& mtrand );
+       friend std::istream& operator>>( std::istream& is, MTRand& mtrand );
+
+protected:
+       void initialize( const uint32 oneSeed );
+       void reload();
+       uint32 hiBit( const uint32& u ) const { return u & 0x80000000UL; }
+       uint32 loBit( const uint32& u ) const { return u & 0x00000001UL; }
+       uint32 loBits( const uint32& u ) const { return u & 0x7fffffffUL; }
+       uint32 mixBits( const uint32& u, const uint32& v ) const
+               { return hiBit(u) | loBits(v); }
+       uint32 twist( const uint32& m, const uint32& s0, const uint32& s1 ) const
+               { return m ^ (mixBits(s0,s1)>>1) ^ (-loBit(s1) & 0x9908b0dfUL); }
+       static uint32 hash( time_t t, clock_t c );
+};
+
+
+inline MTRand::MTRand( const uint32& oneSeed )
+       { seed(oneSeed); }
+
+inline MTRand::MTRand( uint32 *const bigSeed, const uint32 seedLength )
+       { seed(bigSeed,seedLength); }
+
+inline MTRand::MTRand()
+       { seed(); }
+
+inline double MTRand::rand()
+       { return double(randInt()) * (1.0/4294967295.0); }
+
+inline double MTRand::rand( const double& n )
+       { return rand() * n; }
+
+inline double MTRand::randExc()
+       { return double(randInt()) * (1.0/4294967296.0); }
+
+inline double MTRand::randExc( const double& n )
+       { return randExc() * n; }
+
+inline double MTRand::randDblExc()
+       { return ( double(randInt()) + 0.5 ) * (1.0/4294967296.0); }
+
+inline double MTRand::randDblExc( const double& n )
+       { return randDblExc() * n; }
+
+inline double MTRand::rand53()
+{
+       uint32 a = randInt() >> 5, b = randInt() >> 6;
+       return ( a * 67108864.0 + b ) * (1.0/9007199254740992.0);  // by Isaku Wada
+}
+
+inline double MTRand::randNorm( const double& mean, const double& variance )
+{
+       // Return a real number from a normal (Gaussian) distribution with given
+       // mean and variance by Box-Muller method
+       double r = sqrt( -2.0 * log( 1.0-randDblExc()) ) * variance;
+       double phi = 2.0 * 3.14159265358979323846264338328 * randExc();
+       return mean + r * cos(phi);
+}
+
+inline MTRand::uint32 MTRand::randInt()
+{
+       // Pull a 32-bit integer from the generator state
+       // Every other access function simply transforms the numbers extracted here
+       
+       if( left == 0 ) reload();
+       --left;
+               
+       register uint32 s1;
+       s1 = *pNext++;
+       s1 ^= (s1 >> 11);
+       s1 ^= (s1 <<  7) & 0x9d2c5680UL;
+       s1 ^= (s1 << 15) & 0xefc60000UL;
+       return ( s1 ^ (s1 >> 18) );
+}
+
+inline MTRand::uint32 MTRand::randInt( const uint32& n )
+{
+       // Find which bits are used in n
+       // Optimized by Magnus Jonsson (magnus@smartelectronix.com)
+       uint32 used = n;
+       used |= used >> 1;
+       used |= used >> 2;
+       used |= used >> 4;
+       used |= used >> 8;
+       used |= used >> 16;
+       
+       // Draw numbers until one is found in [0,n]
+       uint32 i;
+       do
+               i = randInt() & used;  // toss unused bits to shorten search
+       while( i > n );
+       return i;
+}
+
+
+inline void MTRand::seed( const uint32 oneSeed )
+{
+       // Seed the generator with a simple uint32
+       initialize(oneSeed);
+       reload();
+}
+
+
+inline void MTRand::seed( uint32 *const bigSeed, const uint32 seedLength )
+{
+       // Seed the generator with an array of uint32's
+       // There are 2^19937-1 possible initial states.  This function allows
+       // all of those to be accessed by providing at least 19937 bits (with a
+       // default seed length of N = 624 uint32's).  Any bits above the lower 32
+       // in each element are discarded.
+       // Just call seed() if you want to get array from /dev/urandom
+       initialize(19650218UL);
+       register int i = 1;
+       register uint32 j = 0;
+       register int k = ( N > seedLength ? N : seedLength );
+       for( ; k; --k )
+       {
+               state[i] =
+                       state[i] ^ ( (state[i-1] ^ (state[i-1] >> 30)) * 1664525UL );
+               state[i] += ( bigSeed[j] & 0xffffffffUL ) + j;
+               state[i] &= 0xffffffffUL;
+               ++i;  ++j;
+               if( i >= N ) { state[0] = state[N-1];  i = 1; }
+               if( j >= seedLength ) j = 0;
+       }
+       for( k = N - 1; k; --k )
+       {
+               state[i] =
+                       state[i] ^ ( (state[i-1] ^ (state[i-1] >> 30)) * 1566083941UL );
+               state[i] -= i;
+               state[i] &= 0xffffffffUL;
+               ++i;
+               if( i >= N ) { state[0] = state[N-1];  i = 1; }
+       }
+       state[0] = 0x80000000UL;  // MSB is 1, assuring non-zero initial array
+       reload();
+}
+
+
+inline void MTRand::seed()
+{
+       // Seed the generator with an array from /dev/urandom if available
+       // Otherwise use a hash of time() and clock() values
+       
+       // First try getting an array from /dev/urandom
+       FILE* urandom = fopen( "/dev/urandom", "rb" );
+       if( urandom )
+       {
+               uint32 bigSeed[N];
+               register uint32 *s = bigSeed;
+               register int i = N;
+               register bool success = true;
+               while( success && i-- )
+                       success = fread( s++, sizeof(uint32), 1, urandom );
+               fclose(urandom);
+               if( success ) { seed( bigSeed, N );  return; }
+       }
+       
+       // Was not successful, so use time() and clock() instead
+       seed( hash( time(NULL), clock() ) );
+}
+
+
+inline void MTRand::initialize( const uint32 seed )
+{
+       // Initialize generator state with seed
+       // See Knuth TAOCP Vol 2, 3rd Ed, p.106 for multiplier.
+       // In previous versions, most significant bits (MSBs) of the seed affect
+       // only MSBs of the state array.  Modified 9 Jan 2002 by Makoto Matsumoto.
+       register uint32 *s = state;
+       register uint32 *r = state;
+       register int i = 1;
+       *s++ = seed & 0xffffffffUL;
+       for( ; i < N; ++i )
+       {
+               *s++ = ( 1812433253UL * ( *r ^ (*r >> 30) ) + i ) & 0xffffffffUL;
+               r++;
+       }
+}
+
+
+inline void MTRand::reload()
+{
+       // Generate N new values in state
+       // Made clearer and faster by Matthew Bellew (matthew.bellew@home.com)
+       register uint32 *p = state;
+       register int i;
+       for( i = N - M; i--; ++p )
+               *p = twist( p[M], p[0], p[1] );
+       for( i = M; --i; ++p )
+               *p = twist( p[M-N], p[0], p[1] );
+       *p = twist( p[M-N], p[0], state[0] );
+
+       left = N, pNext = state;
+}
+
+
+inline MTRand::uint32 MTRand::hash( time_t t, clock_t c )
+{
+       // Get a uint32 from t and c
+       // Better than uint32(x) in case x is floating point in [0,1]
+       // Based on code by Lawrence Kirby (fred@genesis.demon.co.uk)
+
+       static uint32 differ = 0;  // guarantee time-based seeds will change
+
+       uint32 h1 = 0;
+       unsigned char *p = (unsigned char *) &t;
+       for( size_t i = 0; i < sizeof(t); ++i )
+       {
+               h1 *= UCHAR_MAX + 2U;
+               h1 += p[i];
+       }
+       uint32 h2 = 0;
+       p = (unsigned char *) &c;
+       for( size_t j = 0; j < sizeof(c); ++j )
+       {
+               h2 *= UCHAR_MAX + 2U;
+               h2 += p[j];
+       }
+       return ( h1 + differ++ ) ^ h2;
+}
+
+
+inline void MTRand::save( uint32* saveArray ) const
+{
+       register uint32 *sa = saveArray;
+       register const uint32 *s = state;
+       register int i = N;
+       for( ; i--; *sa++ = *s++ ) {}
+       *sa = left;
+}
+
+
+inline void MTRand::load( uint32 *const loadArray )
+{
+       register uint32 *s = state;
+       register uint32 *la = loadArray;
+       register int i = N;
+       for( ; i--; *s++ = *la++ ) {}
+       left = *la;
+       pNext = &state[N-left];
+}
+
+
+inline std::ostream& operator<<( std::ostream& os, const MTRand& mtrand )
+{
+       register const MTRand::uint32 *s = mtrand.state;
+       register int i = mtrand.N;
+       for( ; i--; os << *s++ << "\t" ) {}
+       return os << mtrand.left;
+}
+
+
+inline std::istream& operator>>( std::istream& is, MTRand& mtrand )
+{
+       register MTRand::uint32 *s = mtrand.state;
+       register int i = mtrand.N;
+       for( ; i--; is >> *s++ ) {}
+       is >> mtrand.left;
+       mtrand.pNext = &mtrand.state[mtrand.N-mtrand.left];
+       return is;
+}
+};
+
+#endif  // MERSENNETWISTER_H
+
+// Change log:
+//
+// v0.1 - First release on 15 May 2000
+//      - Based on code by Makoto Matsumoto, Takuji Nishimura, and Shawn Cokus
+//      - Translated from C to C++
+//      - Made completely ANSI compliant
+//      - Designed convenient interface for initialization, seeding, and
+//        obtaining numbers in default or user-defined ranges
+//      - Added automatic seeding from /dev/urandom or time() and clock()
+//      - Provided functions for saving and loading generator state
+//
+// v0.2 - Fixed bug which reloaded generator one step too late
+//
+// v0.3 - Switched to clearer, faster reload() code from Matthew Bellew
+//
+// v0.4 - Removed trailing newline in saved generator format to be consistent
+//        with output format of built-in types
+//
+// v0.5 - Improved portability by replacing static const int's with enum's and
+//        clarifying return values in seed(); suggested by Eric Heimburg
+//      - Removed MAXINT constant; use 0xffffffffUL instead
+//
+// v0.6 - Eliminated seed overflow when uint32 is larger than 32 bits
+//      - Changed integer [0,n] generator to give better uniformity
+//
+// v0.7 - Fixed operator precedence ambiguity in reload()
+//      - Added access for real numbers in (0,1) and (0,n)
+//
+// v0.8 - Included time.h header to properly support time_t and clock_t
+//
+// v1.0 - Revised seeding to match 26 Jan 2002 update of Nishimura and Matsumoto
+//      - Allowed for seeding with arrays of any length
+//      - Added access for real numbers in [0,1) with 53-bit resolution
+//      - Added access for real numbers from normal (Gaussian) distributions
+//      - Increased overall speed by optimizing twist()
+//      - Doubled speed of integer [0,n] generation
+//      - Fixed out-of-range number generation on 64-bit machines
+//      - Improved portability by substituting literal constants for long enum's
+//      - Changed license from GNU LGPL to BSD
diff --git a/src/sat/cryptominisat/Makefile b/src/sat/cryptominisat/Makefile
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ffbda1d
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,12 @@
+include   ../../../scripts/Makefile.common
+MTL       = mtl
+CHDRS     = $(wildcard *.h) $(wildcard $(MTL)/*.h)
+EXEC      = minisat
+CFLAGS    += -I$(MTL) -DEXT_HASH_MAP -ffloat-store $(CFLAGS_M32)
+LFLAGS    = -lz
+
+include mtl/template.mk
+all: libminisat.a
+       ranlib libminisat.a
+       cp *.o ../
+       cp libminisat.a ../
diff --git a/src/sat/cryptominisat/Solver.C b/src/sat/cryptominisat/Solver.C
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5559d75
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1264 @@
+/****************************************************************************************[Solver.C]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+#include "Solver.h"
+#include "Sort.h"
+#include <cmath>
+#include <string.h>
+#include <algorithm>
+#include <limits.h>
+#include <vector>
+#include "clause.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// Constructor/Destructor:
+
+
+Solver::Solver() :
+        // Parameters: (formerly in 'SearchParams')
+        var_decay(1 / 0.95), clause_decay(1 / 0.999), random_var_freq(0.02)
+        , restart_first(100), restart_inc(1.5), learntsize_factor((double)1/(double)3), learntsize_inc(1.1)
+
+        // More parameters:
+        //
+        , expensive_ccmin  (true)
+        , polarity_mode    (polarity_user)
+        , verbosity        (0)
+        , restrictedPickBranch(0)
+        , useRealUnknowns(false)
+
+        // Statistics: (formerly in 'SolverStats')
+        //
+        , starts(0), decisions(0), rnd_decisions(0), propagations(0), conflicts(0)
+        , clauses_literals(0), learnts_literals(0), max_literals(0), tot_literals(0)
+
+        , ok               (true)
+        , cla_inc          (1)
+        , var_inc          (1)
+        , qhead            (0)
+        , simpDB_assigns   (-1)
+        , simpDB_props     (0)
+        , order_heap       (VarOrderLt(activity))
+        , progress_estimate(0)
+        , remove_satisfied (true)
+        , mtrand((unsigned long int)0)
+        , logger(verbosity)
+        , dynamic_behaviour_analysis(false) //do not document the proof as default
+        , maxRestarts(UINT_MAX)
+        , learnt_clause_group(0)
+{
+}
+
+
+Solver::~Solver()
+{
+    for (int i = 0; i < learnts.size(); i++) free(learnts[i]);
+    for (int i = 0; i < unitary_learnts.size(); i++) free(unitary_learnts[i]);
+    for (int i = 0; i < clauses.size(); i++) free(clauses[i]);
+    for (int i = 0; i < xorclauses.size(); i++) free(xorclauses[i]);
+}
+
+//=================================================================================================
+// Minor methods:
+
+
+// Creates a new SAT variable in the solver. If 'decision_var' is cleared, variable will not be
+// used as a decision variable (NOTE! This has effects on the meaning of a SATISFIABLE result).
+Var Solver::newVar(bool sign, bool dvar)
+{
+    int v = nVars();
+    watches   .push();          // (list for positive literal)
+    watches   .push();          // (list for negative literal)
+    xorwatches.push();          // (list for variables in xors)
+    reason    .push(NULL);
+    assigns   .push(l_Undef);
+    level     .push(-1);
+    activity  .push(0);
+    seen      .push(0);
+    polarity  .push((char)sign);
+
+    polarity    .push((char)sign);
+    decision_var.push((char)dvar);
+
+    insertVarOrder(v);
+    logger.new_var(v);
+
+    return v;
+}
+
+bool Solver::addXorClause(vec<Lit>& ps, bool xor_clause_inverted, const uint group, const char* group_name)
+{
+    assert(decisionLevel() == 0);
+
+    if (dynamic_behaviour_analysis) logger.set_group_name(group, group_name);
+
+    if (!ok)
+        return false;
+
+    // Check if clause is satisfied and remove false/duplicate literals:
+    sort(ps);
+    Lit p;
+    int i, j;
+    for (i = j = 0, p = lit_Undef; i < ps.size(); i++) {
+        while (ps[i].var() >= nVars()) newVar();
+        xor_clause_inverted ^= ps[i].sign();
+        ps[i] ^= ps[i].sign();
+
+        if (ps[i] == p) {
+            //added, but easily removed
+            j--;
+            p = lit_Undef;
+            if (!assigns[ps[i].var()].isUndef())
+                xor_clause_inverted ^= assigns[ps[i].var()].getBool();
+        } else if (value(ps[i]) == l_Undef) //just add
+            ps[j++] = p = ps[i];
+        else xor_clause_inverted ^= (value(ps[i]) == l_True); //modify xor_clause_inverted instead of adding
+    }
+    ps.shrink(i - j);
+
+    if (ps.size() == 0) {
+        if (xor_clause_inverted)
+            return true;
+
+        if (dynamic_behaviour_analysis) logger.empty_clause(group);
+        return ok = false;
+    } else if (ps.size() == 1) {
+        assert(value(ps[0]) == l_Undef);
+        uncheckedEnqueue( (xor_clause_inverted) ? ~ps[0] : ps[0]);
+        if (dynamic_behaviour_analysis)
+            logger.propagation((xor_clause_inverted) ? ~ps[0] : ps[0], Logger::addclause_type, group);
+        return ok = (propagate() == NULL);
+    } else {
+        learnt_clause_group = std::max(group+1, learnt_clause_group);
+
+        XorClause* c = XorClause_new(ps, xor_clause_inverted, group);
+
+        xorclauses.push(c);
+        attachClause(*c);
+    }
+
+    return true;
+}
+
+bool Solver::addClause(vec<Lit>& ps, const uint group, const char* group_name)
+{
+    assert(decisionLevel() == 0);
+
+    if (dynamic_behaviour_analysis)
+        logger.set_group_name(group, group_name);
+
+    if (!ok)
+        return false;
+
+    // Check if clause is satisfied and remove false/duplicate literals:
+    sort(ps);
+    Lit p;
+    int i, j;
+    for (i = j = 0, p = lit_Undef; i < ps.size(); i++) {
+        while (ps[i].var() >= nVars()) newVar();
+
+        if (value(ps[i]) == l_True || ps[i] == ~p)
+            return true;
+        else if (value(ps[i]) != l_False && ps[i] != p)
+            ps[j++] = p = ps[i];
+    }
+    ps.shrink(i - j);
+
+    if (ps.size() == 0) {
+        if (dynamic_behaviour_analysis) logger.empty_clause(group);
+        return ok = false;
+    } else if (ps.size() == 1) {
+        assert(value(ps[0]) == l_Undef);
+        uncheckedEnqueue(ps[0]);
+        if (dynamic_behaviour_analysis)
+            logger.propagation(ps[0], Logger::addclause_type, group);
+        return ok = (propagate() == NULL);
+    } else {
+        learnt_clause_group = std::max(group+1, learnt_clause_group);
+
+        Clause* c = Clause_new(ps, group);
+
+        clauses.push(c);
+        attachClause(*c);
+    }
+
+    return true;
+}
+
+void Solver::attachClause(XorClause& c)
+{
+    assert(c.size() > 1);
+
+    xorwatches[c[0].var()].push(&c);
+    xorwatches[c[1].var()].push(&c);
+
+    if (c.learnt()) learnts_literals += c.size();
+    else            clauses_literals += c.size();
+}
+
+void Solver::attachClause(Clause& c)
+{
+    assert(c.size() > 1);
+
+    watches[(~c[0]).toInt()].push(&c);
+    watches[(~c[1]).toInt()].push(&c);
+
+    if (c.learnt()) learnts_literals += c.size();
+    else            clauses_literals += c.size();
+}
+
+
+void Solver::detachClause(const XorClause& c)
+{
+    assert(c.size() > 1);
+    assert(find(xorwatches[c[0].var()], &c));
+    assert(find(xorwatches[c[1].var()], &c));
+    remove(xorwatches[c[0].var()], &c);
+    remove(xorwatches[c[1].var()], &c);
+
+    if (c.learnt()) learnts_literals -= c.size();
+    else            clauses_literals -= c.size();
+}
+
+void Solver::detachClause(const Clause& c)
+{
+    assert(c.size() > 1);
+    assert(find(watches[(~c[0]).toInt()], &c));
+    assert(find(watches[(~c[1]).toInt()], &c));
+    remove(watches[(~c[0]).toInt()], &c);
+    remove(watches[(~c[1]).toInt()], &c);
+    if (c.learnt()) learnts_literals -= c.size();
+    else            clauses_literals -= c.size();
+}
+
+template<class T>
+void Solver::removeClause(T& c)
+{
+    detachClause(c);
+    free(&c);
+}
+
+
+bool Solver::satisfied(const Clause& c) const
+{
+    for (uint i = 0; i < c.size(); i++)
+        if (value(c[i]) == l_True)
+            return true;
+    return false;
+}
+
+bool Solver::satisfied(const XorClause& c) const
+{
+    bool final = c.xor_clause_inverted();
+    for (uint k = 0; k < c.size(); k++ ) {
+        const lbool& val = assigns[c[k].var()];
+        if (val.isUndef()) return false;
+        final ^= val.getBool();
+    }
+    return final;
+}
+
+
+// Revert to the state at given level (keeping all assignment at 'level' but not beyond).
+//
+void Solver::cancelUntil(int level)
+{
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Canceling until level " << level;
+    if (level > 0) cout << " sublevel: " << trail_lim[level];
+    cout << endl;
+    #endif
+    
+    if (decisionLevel() > level) {
+        for (int c = trail.size()-1; c >= trail_lim[level]; c--) {
+            Var     x  = trail[c].var();
+            #ifdef VERBOSE_DEBUG
+            cout << "Canceling var " << x+1 << " sublevel:" << c << endl;
+            #endif
+            assigns[x] = l_Undef;
+            insertVarOrder(x);
+        }
+        qhead = trail_lim[level];
+        trail.shrink(trail.size() - trail_lim[level]);
+        trail_lim.shrink(trail_lim.size() - level);
+    }
+
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Canceling finished. (now at level: " << decisionLevel() << " sublevel:" << trail.size()-1 << ")" << endl;
+    #endif
+}
+
+//Permutates the clauses in the solver. Very useful to calcuate the average time it takes the solver to solve the prolbem
+void Solver::permutateClauses()
+{
+    for (int i = 0; i < clauses.size(); i++) {
+        int j = mtrand.randInt(i);
+        Clause* tmp = clauses[i];
+        clauses[i] = clauses[j];
+        clauses[j] = tmp;
+    }
+
+    for (int i = 0; i < xorclauses.size(); i++) {
+        int j = mtrand.randInt(i);
+        XorClause* tmp = xorclauses[i];
+        xorclauses[i] = xorclauses[j];
+        xorclauses[j] = tmp;
+    }
+}
+
+void Solver::setRealUnknown(const uint var)
+{
+    if (realUnknowns.size() < var+1)
+        realUnknowns.resize(var+1, false);
+    realUnknowns[var] = true;
+}
+
+void Solver::printLit(const Lit l) const
+{
+    printf("%s%d:%c", l.sign() ? "-" : "", l.var()+1, value(l) == l_True ? '1' : (value(l) == l_False ? '0' : 'X'));
+}
+
+
+void Solver::printClause(const Clause& c) const
+{
+    printf("(group: %d) ", c.group);
+    for (uint i = 0; i < c.size();) {
+        printLit(c[i]);
+        i++;
+        if (i < c.size()) printf(" ");
+    }
+}
+
+void Solver::printClause(const XorClause& c) const
+{
+    printf("(group: %d) ", c.group);
+    if (c.xor_clause_inverted()) printf(" /inverted/ ");
+    for (uint i = 0; i < c.size();) {
+        printLit(c[i].unsign());
+        i++;
+        if (i < c.size()) printf(" + ");
+    }
+}
+
+//=================================================================================================
+// Major methods:
+
+
+Lit Solver::pickBranchLit(int polarity_mode)
+{
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "decision level:" << decisionLevel() << " ";
+    #endif
+    
+    Var next = var_Undef;
+
+    // Random decision:
+    if (mtrand.randDblExc() < random_var_freq && !order_heap.empty()) {
+        if (restrictedPickBranch == 0) next = order_heap[mtrand.randInt(order_heap.size()-1)];
+        else next = order_heap[mtrand.randInt(std::min((uint32_t)order_heap.size()-1, restrictedPickBranch))];
+
+        if (assigns[next] == l_Undef && decision_var[next])
+            rnd_decisions++;
+    }
+
+    // Activity based decision:
+    //bool dont_do_bad_decision = false;
+    //if (restrictedPickBranch != 0) dont_do_bad_decision = (mtrand.randInt(100) != 0);
+    while (next == var_Undef || assigns[next] != l_Undef || !decision_var[next])
+        if (order_heap.empty()) {
+            next = var_Undef;
+            break;
+        } else {
+            next = order_heap.removeMin();
+        }
+
+    bool sign = false;
+    switch (polarity_mode) {
+    case polarity_true:
+        sign = false;
+        break;
+    case polarity_false:
+        sign = true;
+        break;
+    case polarity_user:
+        if (next != var_Undef)
+            sign = polarity[next];
+        break;
+    case polarity_rnd:
+        sign = mtrand.randInt(1);
+        break;
+    default:
+        assert(false);
+    }
+
+    assert(next == var_Undef || value(next) == l_Undef);
+
+    if (next == var_Undef) {
+        #ifdef VERBOSE_DEBUG
+        cout << "SAT!" << endl;
+        #endif
+        return lit_Undef;
+    } else {
+        Lit lit(next,sign);
+        #ifdef VERBOSE_DEBUG
+        cout << "decided on: " << lit.var()+1 << " to set:" << !lit.sign() << endl;
+        #endif
+        return lit;
+    }
+}
+
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  analyze : (confl : Clause*) (out_learnt : vec<Lit>&) (out_btlevel : int&)  ->  [void]
+|
+|  Description:
+|    Analyze conflict and produce a reason clause.
+|
+|    Pre-conditions:
+|      * 'out_learnt' is assumed to be cleared.
+|      * Current decision level must be greater than root level.
+|
+|    Post-conditions:
+|      * 'out_learnt[0]' is the asserting literal at level 'out_btlevel'.
+|
+|  Effect:
+|    Will undo part of the trail, upto but not beyond the assumption of the current decision level.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+void Solver::analyze(Clause* confl, vec<Lit>& out_learnt, int& out_btlevel)
+{
+    int pathC = 0;
+    Lit p     = lit_Undef;
+
+    // Generate conflict clause:
+    //
+    out_learnt.push();      // (leave room for the asserting literal)
+    int index   = trail.size() - 1;
+    out_btlevel = 0;
+
+    do {
+        assert(confl != NULL);          // (otherwise should be UIP)
+        Clause& c = *confl;
+
+        if (c.learnt())
+            claBumpActivity(c);
+
+        for (uint j = (p == lit_Undef) ? 0 : 1; j < c.size(); j++) {
+            const Lit& q = c[j];
+            const uint my_var = q.var();
+
+            if (!seen[my_var] && level[my_var] > 0) {
+                if (!useRealUnknowns || (my_var < realUnknowns.size() && realUnknowns[my_var]))
+                    varBumpActivity(my_var);
+                seen[my_var] = 1;
+                if (level[my_var] >= decisionLevel())
+                    pathC++;
+                else {
+                    out_learnt.push(q);
+                    if (level[my_var] > out_btlevel)
+                        out_btlevel = level[my_var];
+                }
+            }
+        }
+
+        // Select next clause to look at:
+        while (!seen[trail[index--].var()]);
+        p     = trail[index+1];
+        confl = reason[p.var()];
+        seen[p.var()] = 0;
+        pathC--;
+
+    } while (pathC > 0);
+    out_learnt[0] = ~p;
+
+    // Simplify conflict clause:
+    //
+    int i, j;
+    if (expensive_ccmin) {
+        uint32_t abstract_level = 0;
+        for (i = 1; i < out_learnt.size(); i++)
+            abstract_level |= abstractLevel(out_learnt[i].var()); // (maintain an abstraction of levels involved in conflict)
+
+        out_learnt.copyTo(analyze_toclear);
+        for (i = j = 1; i < out_learnt.size(); i++)
+            if (reason[out_learnt[i].var()] == NULL || !litRedundant(out_learnt[i], abstract_level))
+                out_learnt[j++] = out_learnt[i];
+    } else {
+        out_learnt.copyTo(analyze_toclear);
+        for (i = j = 1; i < out_learnt.size(); i++) {
+            const Clause& c = *reason[out_learnt[i].var()];
+            for (uint k = 1; k < c.size(); k++)
+                if (!seen[c[k].var()] && level[c[k].var()] > 0) {
+                    out_learnt[j++] = out_learnt[i];
+                    break;
+                }
+        }
+    }
+    max_literals += out_learnt.size();
+    out_learnt.shrink(i - j);
+    tot_literals += out_learnt.size();
+
+    // Find correct backtrack level:
+    //
+    if (out_learnt.size() == 1)
+        out_btlevel = 0;
+    else {
+        int max_i = 1;
+        for (int i = 2; i < out_learnt.size(); i++)
+            if (level[out_learnt[i].var()] > level[out_learnt[max_i].var()])
+                max_i = i;
+        Lit p             = out_learnt[max_i];
+        out_learnt[max_i] = out_learnt[1];
+        out_learnt[1]     = p;
+        out_btlevel       = level[p.var()];
+    }
+
+
+    for (int j = 0; j < analyze_toclear.size(); j++) seen[analyze_toclear[j].var()] = 0;    // ('seen[]' is now cleared)
+}
+
+
+// Check if 'p' can be removed. 'abstract_levels' is used to abort early if the algorithm is
+// visiting literals at levels that cannot be removed later.
+bool Solver::litRedundant(Lit p, uint32_t abstract_levels)
+{
+    analyze_stack.clear();
+    analyze_stack.push(p);
+    int top = analyze_toclear.size();
+    while (analyze_stack.size() > 0) {
+        assert(reason[analyze_stack.last().var()] != NULL);
+        const Clause& c = *reason[analyze_stack.last().var()];
+        analyze_stack.pop();
+
+        for (uint i = 1; i < c.size(); i++) {
+            Lit p  = c[i];
+            if (!seen[p.var()] && level[p.var()] > 0) {
+                if (reason[p.var()] != NULL && (abstractLevel(p.var()) & abstract_levels) != 0) {
+                    seen[p.var()] = 1;
+                    analyze_stack.push(p);
+                    analyze_toclear.push(p);
+                } else {
+                    for (int j = top; j < analyze_toclear.size(); j++)
+                        seen[analyze_toclear[j].var()] = 0;
+                    analyze_toclear.shrink(analyze_toclear.size() - top);
+                    return false;
+                }
+            }
+        }
+    }
+
+    return true;
+}
+
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  analyzeFinal : (p : Lit)  ->  [void]
+|
+|  Description:
+|    Specialized analysis procedure to express the final conflict in terms of assumptions.
+|    Calculates the (possibly empty) set of assumptions that led to the assignment of 'p', and
+|    stores the result in 'out_conflict'.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+void Solver::analyzeFinal(Lit p, vec<Lit>& out_conflict)
+{
+    out_conflict.clear();
+    out_conflict.push(p);
+
+    if (decisionLevel() == 0)
+        return;
+
+    seen[p.var()] = 1;
+
+    for (int i = trail.size()-1; i >= trail_lim[0]; i--) {
+        Var x = trail[i].var();
+        if (seen[x]) {
+            if (reason[x] == NULL) {
+                assert(level[x] > 0);
+                out_conflict.push(~trail[i]);
+            } else {
+                const Clause& c = *reason[x];
+                for (uint j = 1; j < c.size(); j++)
+                    if (level[c[j].var()] > 0)
+                        seen[c[j].var()] = 1;
+            }
+            seen[x] = 0;
+        }
+    }
+
+    seen[p.var()] = 0;
+}
+
+
+void Solver::uncheckedEnqueue(Lit p, Clause* from)
+{
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "uncheckedEnqueue var " << p.var()+1 << " to " << !p.sign() << " level: " << decisionLevel() << " sublevel:" << trail.size() << endl;
+    #endif
+    
+    assert(value(p) == l_Undef);
+    const Var v = p.var();
+    assigns [v] = boolToLBool(!p.sign());//lbool(!sign(p));  // <<== abstract but not uttermost effecient
+    level   [v] = decisionLevel();
+    reason  [v] = from;
+    polarity[p.var()] = p.sign();
+    trail.push(p);
+}
+
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  propagate : [void]  ->  [Clause*]
+|
+|  Description:
+|    Propagates all enqueued facts. If a conflict arises, the conflicting clause is returned,
+|    otherwise NULL.
+|
+|    Post-conditions:
+|      * the propagation queue is empty, even if there was a conflict.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+Clause* Solver::propagate(const bool xor_as_well)
+{
+    Clause* confl = NULL;
+    int     num_props = 0;
+    
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Propagation started" << endl;
+    #endif
+
+    while (qhead < trail.size()) {
+        Lit            p   = trail[qhead++];     // 'p' is enqueued fact to propagate.
+        vec<Clause*>&  ws  = watches[p.toInt()];
+        Clause         **i, **j, **end;
+        num_props++;
+        
+        #ifdef VERBOSE_DEBUG
+        cout << "Propagating lit " << (p.sign() ? '-' : ' ') << p.var()+1 << endl;
+        #endif
+
+        for (i = j = ws.getData(), end = i + ws.size();  i != end;) {
+            Clause& c = **i++;
+
+            // Make sure the false literal is data[1]:
+            const Lit false_lit(~p);
+            if (c[0] == false_lit)
+                c[0] = c[1], c[1] = false_lit;
+
+            assert(c[1] == false_lit);
+
+            // If 0th watch is true, then clause is already satisfied.
+            const Lit& first = c[0];
+            if (value(first) == l_True) {
+                *j++ = &c;
+            } else {
+                // Look for new watch:
+                for (uint k = 2; k < c.size(); k++)
+                    if (value(c[k]) != l_False) {
+                        c[1] = c[k];
+                        c[k] = false_lit;
+                        watches[(~c[1]).toInt()].push(&c);
+                        goto FoundWatch;
+                    }
+
+                // Did not find watch -- clause is unit under assignment:
+                *j++ = &c;
+                if (value(first) == l_False) {
+                    confl = &c;
+                    qhead = trail.size();
+                    // Copy the remaining watches:
+                    while (i < end)
+                        *j++ = *i++;
+                } else {
+                    uncheckedEnqueue(first, &c);
+                    if (dynamic_behaviour_analysis)
+                        logger.propagation(first,Logger::simple_propagation_type,c.group);
+                }
+            }
+FoundWatch:
+            ;
+        }
+        ws.shrink(i - j);
+
+        if (xor_as_well && !confl) confl = propagate_xors(p);
+    }
+    propagations += num_props;
+    simpDB_props -= num_props;
+    
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Propagation ended." << endl;
+    #endif
+
+    return confl;
+}
+
+Clause* Solver::propagate_xors(const Lit& p)
+{
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+    cout << "Xor-Propagating variable " <<  p.var()+1 << endl;
+    #endif
+    
+    Clause* confl = NULL;
+
+    vec<XorClause*>&  ws  = xorwatches[p.var()];
+    XorClause         **i, **j, **end;
+    for (i = j = ws.getData(), end = i + ws.size();  i != end;) {
+        XorClause& c = **i++;
+
+        // Make sure the false literal is data[1]:
+        if (c[0].var() == p.var()) {
+            Lit tmp(c[0]);
+            c[0] = c[1];
+            c[1] = tmp;
+        }
+        assert(c[1].var() == p.var());
+        
+        #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+        cout << "--> xor thing -- " << endl;
+        printClause(c);
+        cout << endl;
+        #endif
+        bool final = c.xor_clause_inverted();
+        for (int k = 0, size = c.size(); k < size; k++ ) {
+            const lbool& val = assigns[c[k].var()];
+            if (val.isUndef() && k >= 2) {
+                Lit tmp(c[1]);
+                c[1] = c[k];
+                c[k] = tmp;
+                #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+                cout << "new watch set" << endl << endl;
+                #endif
+                xorwatches[c[1].var()].push(&c);
+                goto FoundWatch;
+            }
+
+            c[k] = c[k].unsign() ^ val.getBool();
+            final ^= val.getBool();
+        }
+
+
+        {
+            // Did not find watch -- clause is unit under assignment:
+            *j++ = &c;
+
+            #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+            cout << "final: " << std::boolalpha << final << " - ";
+            #endif
+            if (assigns[c[0].var()].isUndef()) {
+                c[0] = c[0].unsign()^final;
+                
+                #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+                cout << "propagating ";
+                printLit(c[0]);
+                cout << endl;
+                cout << "propagation clause -- ";
+                printClause(*(Clause*)&c);
+                cout << endl << endl;
+                #endif
+                
+                uncheckedEnqueue(c[0], (Clause*)&c);
+                if (dynamic_behaviour_analysis)
+                    logger.propagation(c[0], Logger::simple_propagation_type, c.group);
+            } else if (!final) {
+                
+                #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+                printf("conflict clause -- ");
+                printClause(*(Clause*)&c);
+                cout << endl << endl;
+                #endif
+                
+                confl = (Clause*)&c;
+                qhead = trail.size();
+                // Copy the remaining watches:
+                while (i < end)
+                    *j++ = *i++;
+            } else {
+                #ifdef VERBOSE_DEBUG_XOR
+                printf("xor satisfied\n");
+                #endif
+                
+                Lit tmp(c[0]);
+                c[0] = c[1];
+                c[1] = tmp;
+            }
+        }
+FoundWatch:
+        ;
+    }
+    ws.shrink(i - j);
+
+    return confl;
+}
+
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  reduceDB : ()  ->  [void]
+|
+|  Description:
+|    Remove half of the learnt clauses, minus the clauses locked by the current assignment. Locked
+|    clauses are clauses that are reason to some assignment. Binary clauses are never removed.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+struct reduceDB_lt {
+    bool operator () (Clause* x, Clause* y) {
+        return x->size() > 2 && (y->size() == 2 || x->activity() < y->activity());
+    }
+};
+void Solver::reduceDB()
+{
+    int     i, j;
+    double  extra_lim = cla_inc / learnts.size();    // Remove any clause below this activity
+
+    sort(learnts, reduceDB_lt());
+    for (i = j = 0; i < learnts.size() / 2; i++) {
+        if (learnts[i]->size() > 2 && !locked(*learnts[i]))
+            removeClause(*learnts[i]);
+        else
+            learnts[j++] = learnts[i];
+    }
+    for (; i < learnts.size(); i++) {
+        if (learnts[i]->size() > 2 && !locked(*learnts[i]) && learnts[i]->activity() < extra_lim)
+            removeClause(*learnts[i]);
+        else
+            learnts[j++] = learnts[i];
+    }
+    learnts.shrink(i - j);
+}
+
+const vec<Clause*>& Solver::get_sorted_learnts()
+{
+    sort(learnts, reduceDB_lt());
+    return learnts;
+}
+
+const vec<Clause*>& Solver::get_unitary_learnts() const
+{
+    return unitary_learnts;
+}
+
+void Solver::setMaxRestarts(const uint num)
+{
+    maxRestarts = num;
+}
+
+template<class T>
+void Solver::removeSatisfied(vec<T*>& cs)
+{
+    int i,j;
+    for (i = j = 0; i < cs.size(); i++) {
+        if (satisfied(*cs[i]))
+            removeClause(*cs[i]);
+        else
+            cs[j++] = cs[i];
+    }
+    cs.shrink(i - j);
+}
+
+void Solver::cleanClauses(vec<Clause*>& cs)
+{
+    uint useful = 0;
+    for (int s = 0; s < cs.size(); s++) {
+        Clause& c = *cs[s];
+        Lit *i, *j, *end;
+        uint at = 0;
+        for (i = j = c.getData(), end = i + c.size();  i != end; i++, at++) {
+            if (value(*i) == l_Undef) {
+                *j = *i;
+                j++;
+            } else assert(at > 1);
+            assert(value(*i) != l_True);
+        }
+        c.shrink(i-j);
+        if (i-j > 0) useful++;
+    }
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "cleanClauses(Clause) useful:" << useful << endl;
+    #endif
+}
+
+void Solver::cleanClauses(vec<XorClause*>& cs)
+{
+    uint useful = 0;
+    for (int s = 0; s < cs.size(); s++) {
+        XorClause& c = *cs[s];
+        Lit *i, *j, *end;
+        uint at = 0;
+        for (i = j = c.getData(), end = i + c.size();  i != end; i++, at++) {
+            const lbool& val = assigns[i->var()];
+            if (val.isUndef()) {
+                *j = *i;
+                j++;
+            } else /*assert(at>1),*/ c.invert(val.getBool());
+        }
+        c.shrink(i-j);
+        if (i-j > 0) useful++;
+    }
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "cleanClauses(XorClause) useful:" << useful << endl;
+    #endif
+}
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  simplify : [void]  ->  [bool]
+|
+|  Description:
+|    Simplify the clause database according to the current top-level assigment. Currently, the only
+|    thing done here is the removal of satisfied clauses, but more things can be put here.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+lbool Solver::simplify()
+{
+    assert(decisionLevel() == 0);
+
+    if (!ok || propagate() != NULL) {
+        if (dynamic_behaviour_analysis) {
+            logger.end(Logger::unsat_model_found);
+            logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+        }
+        ok = false;
+        return l_False;
+    }
+
+    if (nAssigns() == simpDB_assigns || (simpDB_props > 0)) {
+        return l_Undef;
+    }
+
+    // Remove satisfied clauses:
+    removeSatisfied(learnts);
+    if (remove_satisfied) {       // Can be turned off.
+        removeSatisfied(clauses);
+        removeSatisfied(xorclauses);
+    }
+
+    // Remove fixed variables from the variable heap:
+    order_heap.filter(VarFilter(*this));
+
+    simpDB_assigns = nAssigns();
+    simpDB_props   = clauses_literals + learnts_literals;   // (shouldn't depend on stats really, but it will do for now)
+
+    //cleanClauses(clauses);
+    cleanClauses(xorclauses);
+    //cleanClauses(learnts);
+
+    return l_Undef;
+}
+
+
+/*_________________________________________________________________________________________________
+|
+|  search : (nof_conflicts : int) (nof_learnts : int) (params : const SearchParams&)  ->  [lbool]
+|
+|  Description:
+|    Search for a model the specified number of conflicts, keeping the number of learnt clauses
+|    below the provided limit. NOTE! Use negative value for 'nof_conflicts' or 'nof_learnts' to
+|    indicate infinity.
+|
+|  Output:
+|    'l_True' if a partial assigment that is consistent with respect to the clauseset is found. If
+|    all variables are decision variables, this means that the clause set is satisfiable. 'l_False'
+|    if the clause set is unsatisfiable. 'l_Undef' if the bound on number of conflicts is reached.
+|________________________________________________________________________________________________@*/
+lbool Solver::search(int nof_conflicts, int nof_learnts)
+{
+    assert(ok);
+    int         conflictC = 0;
+    vec<Lit>    learnt_clause;
+    llbool      ret;
+
+    starts++;
+
+    if (dynamic_behaviour_analysis) logger.begin();
+
+    for (;;) {
+        Clause* confl = propagate();
+
+        if (confl != NULL) {
+            ret = handle_conflict(learnt_clause, confl, conflictC);
+            if (ret != l_Nothing) return ret;
+        } else {
+            ret = new_decision(nof_conflicts, nof_learnts, conflictC);
+            if (ret != l_Nothing) return ret;
+        }
+    }
+}
+
+llbool Solver::new_decision(int& nof_conflicts, int& nof_learnts, int& conflictC)
+{
+    if (nof_conflicts >= 0 && conflictC >= nof_conflicts) {
+        // Reached bound on number of conflicts:
+        progress_estimate = progressEstimate();
+        cancelUntil(0);
+        if (dynamic_behaviour_analysis) {
+            logger.end(Logger::restarting);
+            logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+        }
+        return l_Undef;
+    }
+
+    // Simplify the set of problem clauses:
+    if (decisionLevel() == 0 && simplify() == l_False) {
+        if (dynamic_behaviour_analysis) {
+            logger.end(Logger::unsat_model_found);
+            logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+        }
+        return l_False;
+    }
+
+    if (nof_learnts >= 0 && learnts.size()-nAssigns() >= nof_learnts)
+        // Reduce the set of learnt clauses:
+        reduceDB();
+
+    Lit next = lit_Undef;
+    while (decisionLevel() < assumptions.size()) {
+        // Perform user provided assumption:
+        Lit p = assumptions[decisionLevel()];
+        if (value(p) == l_True) {
+            // Dummy decision level:
+            newDecisionLevel();
+            if (dynamic_behaviour_analysis) logger.propagation(p, Logger::assumption_type);
+        } else if (value(p) == l_False) {
+            analyzeFinal(~p, conflict);
+            if (dynamic_behaviour_analysis) {
+                logger.end(Logger::unsat_model_found);
+                logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+            }
+            return l_False;
+        } else {
+            next = p;
+            break;
+        }
+    }
+
+    if (next == lit_Undef) {
+        // New variable decision:
+        decisions++;
+        next = pickBranchLit(polarity_mode);
+
+        if (next == lit_Undef) {
+            // Model found:
+            if (dynamic_behaviour_analysis) {
+                logger.end(Logger::model_found);
+                logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+            }
+            return l_True;
+        }
+    }
+
+    // Increase decision level and enqueue 'next'
+    assert(value(next) == l_Undef);
+    newDecisionLevel();
+    uncheckedEnqueue(next);
+    if (dynamic_behaviour_analysis) logger.propagation(next, Logger::guess_type);
+
+    return l_Nothing;
+}
+
+llbool Solver::handle_conflict(vec<Lit>& learnt_clause, Clause* confl, int& conflictC)
+{
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Handling conflict: ";
+    for (uint i = 0; i < learnt_clause.size(); i++)
+        cout << learnt_clause[i].var()+1 << ",";
+    cout << endl;
+    #endif
+    
+    int backtrack_level;
+
+    conflicts++;
+    conflictC++;
+    if (decisionLevel() == 0) {
+        if (dynamic_behaviour_analysis) {
+            logger.end(Logger::unsat_model_found);
+            logger.print_general_stats(starts, conflicts, order_heap.size(), nClauses(), clauses_literals, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100);
+        }
+        return l_False;
+    }
+    learnt_clause.clear();
+    analyze(confl, learnt_clause, backtrack_level);
+    cancelUntil(backtrack_level);
+    if (dynamic_behaviour_analysis)
+        logger.conflict(Logger::simple_confl_type, backtrack_level, confl->group, learnt_clause);
+    
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    cout << "Learning:";
+    for (uint i = 0; i < learnt_clause.size(); i++) printLit(learnt_clause[i]), cout << " ";
+    cout << endl;
+    cout << "reverting var " << learnt_clause[0].var()+1 << " to " << !learnt_clause[0].sign() << endl;
+    #endif
+    
+    assert(value(learnt_clause[0]) == l_Undef);
+    //Unitary learnt
+    if (learnt_clause.size() == 1) {
+        Clause* c = Clause_new(learnt_clause, learnt_clause_group++, true);
+        unitary_learnts.push(c);
+        uncheckedEnqueue(learnt_clause[0]);
+        if (dynamic_behaviour_analysis)
+            logger.propagation(learnt_clause[0], Logger::learnt_unit_clause_type);
+        assert(backtrack_level == 0 && "Unit clause learnt, so must cancel until level 0, right?");
+        
+        #ifdef VERBOSE_DEBUG
+        cout << "Unit clause learnt." << endl;
+        #endif
+    //Normal learnt
+    } else {
+        Clause* c = Clause_new(learnt_clause, learnt_clause_group++, true);
+        learnts.push(c);
+        attachClause(*c);
+        claBumpActivity(*c);
+        uncheckedEnqueue(learnt_clause[0], c);
+
+        if (dynamic_behaviour_analysis) {
+            logger.propagation(learnt_clause[0], Logger::revert_guess_type, c->group);
+            logger.new_group(c->group);
+            logger.set_group_name(c->group, "learnt clause");
+        }
+    }
+
+    varDecayActivity();
+    claDecayActivity();
+
+    return l_Nothing;
+}
+
+
+double Solver::progressEstimate() const
+{
+    double  progress = 0;
+    double  F = 1.0 / nVars();
+
+    for (int i = 0; i <= decisionLevel(); i++) {
+        int beg = i == 0 ? 0 : trail_lim[i - 1];
+        int end = i == decisionLevel() ? trail.size() : trail_lim[i];
+        progress += pow(F, i) * (end - beg);
+    }
+
+    return progress / nVars();
+}
+
+
+lbool Solver::solve(const vec<Lit>& assumps)
+{
+    model.clear();
+    conflict.clear();
+
+    if (!ok) return l_False;
+
+    assumps.copyTo(assumptions);
+
+    double  nof_conflicts = restart_first;
+    double  nof_learnts   = nClauses() * learntsize_factor;
+    lbool   status        = l_Undef;
+
+    if (verbosity >= 1) {
+        printf("============================[ Search Statistics ]==============================\n");
+        printf("| Conflicts |          ORIGINAL         |          LEARNT          | Progress |\n");
+        printf("|           |    Vars  Clauses Literals |    Limit  Clauses Lit/Cl |          |\n");
+        printf("===============================================================================\n");
+    }
+
+    // Search:
+    while (status == l_Undef && starts < maxRestarts) {
+        if (verbosity >= 1 && !(dynamic_behaviour_analysis && logger.statistics_on))  {
+            printf("| %9d | %7d %8d %8d | %8d %8d %6.0f | %6.3f %% |", (int)conflicts, order_heap.size(), nClauses(), (int)clauses_literals, (int)nof_learnts, nLearnts(), (double)learnts_literals/nLearnts(), progress_estimate*100), fflush(stdout);
+            printf("\n");
+        }
+        status = search((int)nof_conflicts, (int)nof_learnts);
+        nof_conflicts *= restart_inc;
+        nof_learnts   *= learntsize_inc;
+    }
+
+    if (verbosity >= 1) {
+        printf("===============================================================================");
+        printf("\n");
+    }
+
+    if (status == l_True) {
+        // Extend & copy model:
+        model.growTo(nVars());
+        for (int i = 0; i < nVars(); i++) model[i] = value(i);
+#ifndef NDEBUG
+        verifyModel();
+#endif
+    } if (status == l_False) {
+        if (conflict.size() == 0)
+            ok = false;
+    }
+
+    cancelUntil(0);
+    return status;
+}
+
+//=================================================================================================
+// Debug methods:
+
+
+void Solver::verifyModel()
+{
+    bool failed = false;
+    for (int i = 0; i < clauses.size(); i++) {
+        Clause& c = *clauses[i];
+        for (uint j = 0; j < c.size(); j++)
+            if (modelValue(c[j]) == l_True)
+                goto next;
+
+        printf("unsatisfied clause: ");
+        printClause(*clauses[i]);
+        printf("\n");
+        failed = true;
+next:
+        ;
+    }
+
+    for (int i = 0; i < xorclauses.size(); i++) {
+        XorClause& c = *xorclauses[i];
+        bool final = c.xor_clause_inverted();
+        for (uint j = 0; j < c.size(); j++)
+            final ^= (modelValue(c[j].unsign()) == l_True);
+        if (!final) {
+            printf("unsatisfied clause: ");
+            printClause(*xorclauses[i]);
+            printf("\n");
+            failed = true;
+        }
+    }
+
+    assert(!failed);
+
+    printf("Verified %d original clauses.\n", clauses.size() + xorclauses.size());
+}
+
+
+void Solver::checkLiteralCount()
+{
+    // Check that sizes are calculated correctly:
+    int cnt = 0;
+    for (int i = 0; i < clauses.size(); i++)
+        cnt += clauses[i]->size();
+
+    for (int i = 0; i < xorclauses.size(); i++)
+        cnt += xorclauses[i]->size();
+
+    if ((int)clauses_literals != cnt) {
+        fprintf(stderr, "literal count: %d, real value = %d\n", (int)clauses_literals, cnt);
+        assert((int)clauses_literals == cnt);
+    }
+}
+};
diff --git a/src/sat/cryptominisat/Solver.h b/src/sat/cryptominisat/Solver.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b5a2d78
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,431 @@
+/****************************************************************************************[Solver.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Solver_h
+#define Solver_h
+
+#include <cstdio>
+#include "mtl/Vec.h"
+#include "mtl/Heap.h"
+#include "mtl/Alg.h"
+#include "Logger.h"
+#include "MTRand/MersenneTwister.h"
+#include "SolverTypes.h"
+#include "clause.h"
+#include <string.h>
+
+#ifdef _MSC_VER
+  #include <ctime>
+#else
+  #include <sys/time.h>
+  #include <sys/resource.h>
+  #include <unistd.h>
+#endif
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//#define VERBOSE_DEBUG_XOR
+//#define VERBOSE_DEBUG
+
+//=================================================================================================
+// Solver -- the main class:
+
+
+class Solver
+{
+public:
+
+    // Constructor/Destructor:
+    //
+    Solver();
+    ~Solver();
+
+    // Problem specification:
+    //
+    Var     newVar    (bool polarity = true, bool dvar = true); // Add a new variable with parameters specifying variable mode.
+    bool    addClause (vec<Lit>& ps, const uint group, const char* group_name);  // Add a clause to the solver. NOTE! 'ps' may be shrunk by this method!
+    bool    addXorClause (vec<Lit>& ps, bool xor_clause_inverted, const uint group, const char* group_name);  // Add a xor-clause to the solver. NOTE! 'ps' may be shrunk by this method!
+
+    // Solving:
+    //
+    lbool    simplify    ();                        // Removes already satisfied clauses.
+    lbool    solve       (const vec<Lit>& assumps); // Search for a model that respects a given set of assumptions.
+    lbool    solve       ();                        // Search without assumptions.
+    bool    okay         () const;                  // FALSE means solver is in a conflicting state
+
+    // Variable mode:
+    //
+    void    setPolarity    (Var v, bool b); // Declare which polarity the decision heuristic should use for a variable. Requires mode 'polarity_user'.
+    void    setDecisionVar (Var v, bool b); // Declare if a variable should be eligible for selection in the decision heuristic.
+    void    setSeed (const uint32_t seed);  // Sets the seed to be the given number
+    void    permutateClauses();             // Permutates the clauses using the seed. It updates the seed in mtrand
+    void    needRealUnknowns();             // Uses the "real unknowns" set by setRealUnknown
+    void    setRealUnknown(const uint var); //sets a variable to be 'real', i.e. to preferentially branch on it during solving (when useRealUnknown it turned on)
+    void    setMaxRestarts(const uint num); //sets the maximum number of restarts to given value
+
+    // Read state:
+    //
+    lbool   value      (const Var& x) const;       // The current value of a variable.
+    lbool   value      (const Lit& p) const;       // The current value of a literal.
+    lbool   modelValue (const Lit& p) const;       // The value of a literal in the last model. The last call to solve must have been satisfiable.
+    int     nAssigns   ()      const;       // The current number of assigned literals.
+    int     nClauses   ()      const;       // The current number of original clauses.
+    int     nLearnts   ()      const;       // The current number of learnt clauses.
+    int     nVars      ()      const;       // The current number of variables.
+
+    // Extra results: (read-only member variable)
+    //
+    vec<lbool> model;             // If problem is satisfiable, this vector contains the model (if any).
+    vec<Lit>   conflict;          // If problem is unsatisfiable (possibly under assumptions),
+    // this vector represent the final conflict clause expressed in the assumptions.
+
+    // Mode of operation:
+    //
+    double    var_decay;          // Inverse of the variable activity decay factor.                                            (default 1 / 0.95)
+    double    clause_decay;       // Inverse of the clause activity decay factor.                                              (1 / 0.999)
+    double    random_var_freq;    // The frequency with which the decision heuristic tries to choose a random variable.        (default 0.02)
+    int       restart_first;      // The initial restart limit.                                                                (default 100)
+    double    restart_inc;        // The factor with which the restart limit is multiplied in each restart.                    (default 1.5)
+    double    learntsize_factor;  // The intitial limit for learnt clauses is a factor of the original clauses.                (default 1 / 3)
+    double    learntsize_inc;     // The limit for learnt clauses is multiplied with this factor each restart.                 (default 1.1)
+    bool      expensive_ccmin;    // Controls conflict clause minimization.                                                    (default TRUE)
+    int       polarity_mode;      // Controls which polarity the decision heuristic chooses. See enum below for allowed modes. (default polarity_false)
+    int       verbosity;          // Verbosity level. 0=silent, 1=some progress report                                         (default 0)
+    uint      restrictedPickBranch; // Pick variables to branch on preferentally from the highest [0, restrictedPickBranch]. If set to 0, preferentiality is turned off (i.e. picked randomly between [0, all])
+    bool      useRealUnknowns;    // Whether 'real unknown' optimization should be used. If turned on, VarActivity is only bumped for variables for which the real_unknowns[var] == true
+    vector<bool> realUnknowns;    // The important variables. This vector stores 'false' at realUnknowns[var] if the var is not a real unknown, and stores a 'true' if it is a real unkown. If var is larger than realUnkowns.size(), then it is not an important variable
+
+    enum { polarity_true = 0, polarity_false = 1, polarity_user = 2, polarity_rnd = 3 };
+
+    // Statistics: (read-only member variable)
+    //
+    uint64_t starts, decisions, rnd_decisions, propagations, conflicts;
+    uint64_t clauses_literals, learnts_literals, max_literals, tot_literals;
+
+    //Logging
+    void needStats();              // Prepares the solver to output statistics
+    void needProofGraph();         // Prepares the solver to output proof graphs during solving
+    void setVariableName(int var, const char* name); // Sets the name of the variable 'var' to 'name'. Useful for statistics and proof logs (i.e. used by 'logger')
+    void startClauseAdding();      // Before adding clauses, but after setting up the Solver (need* functions, verbosity), this should be called
+    void endFirstSimplify();       // After the clauses are added, and the first simplify() is called, this must be called
+    const vec<Clause*>& get_sorted_learnts(); //return the set of learned clauses
+    const vec<Clause*>& get_unitary_learnts() const; //return the set of unitary learned clauses
+
+protected:
+    // Helper structures:
+    //
+    struct VarOrderLt {
+        const vec<double>&  activity;
+        bool operator () (Var x, Var y) const {
+            return activity[x] > activity[y];
+        }
+        VarOrderLt(const vec<double>&  act) : activity(act) { }
+    };
+
+    friend class VarFilter;
+    struct VarFilter {
+        const Solver& s;
+        VarFilter(const Solver& _s) : s(_s) {}
+        bool operator()(Var v) const {
+            return s.assigns[v].isUndef() && s.decision_var[v];
+        }
+    };
+
+    // Solver state:
+    //
+    bool                ok;               // If FALSE, the constraints are already unsatisfiable. No part of the solver state may be used!
+    vec<Clause*>        clauses;          // List of problem clauses.
+    vec<XorClause*>     xorclauses;       // List of problem xor-clauses.
+    vec<Clause*>        learnts;          // List of learnt clauses.
+    vec<Clause*>        unitary_learnts;  // List of learnt clauses.
+    double              cla_inc;          // Amount to bump next clause with.
+    vec<double>         activity;         // A heuristic measurement of the activity of a variable.
+    double              var_inc;          // Amount to bump next variable with.
+    vec<vec<Clause*> >  watches;          // 'watches[lit]' is a list of constraints watching 'lit' (will go there if literal becomes true).
+    vec<vec<XorClause*> >  xorwatches;    // 'xorwatches[var]' is a list of constraints watching var in XOR clauses.
+    vec<lbool>          assigns;          // The current assignments
+    vec<char>           polarity;         // The preferred polarity of each variable.
+    vec<char>           decision_var;     // Declares if a variable is eligible for selection in the decision heuristic.
+    vec<Lit>            trail;            // Assignment stack; stores all assigments made in the order they were made.
+    vec<int32_t>        trail_lim;        // Separator indices for different decision levels in 'trail'.
+    vec<Clause*>        reason;           // 'reason[var]' is the clause that implied the variables current value, or 'NULL' if none.
+    vec<int32_t>        level;            // 'level[var]' contains the level at which the assignment was made.
+    int                 qhead;            // Head of queue (as index into the trail -- no more explicit propagation queue in MiniSat).
+    int                 simpDB_assigns;   // Number of top-level assignments since last execution of 'simplify()'.
+    int64_t             simpDB_props;     // Remaining number of propagations that must be made before next execution of 'simplify()'.
+    vec<Lit>            assumptions;      // Current set of assumptions provided to solve by the user.
+    Heap<VarOrderLt>    order_heap;       // A priority queue of variables ordered with respect to the variable activity.
+    double              progress_estimate;// Set by 'search()'.
+    bool                remove_satisfied; // Indicates whether possibly inefficient linear scan for satisfied clauses should be performed in 'simplify'.
+    MTRand mtrand;                        // random number generator
+    Logger logger;                        // dynamic logging, statistics
+    bool dynamic_behaviour_analysis;      //should 'logger' be called whenever a propagation/conflict/decision is made?
+    uint                maxRestarts;      // More than this number of restarts will not be performed
+
+    // Temporaries (to reduce allocation overhead). Each variable is prefixed by the method in which it is
+    // used, exept 'seen' wich is used in several places.
+    //
+    vec<char>           seen;
+    vec<Lit>            analyze_stack;
+    vec<Lit>            analyze_toclear;
+    vec<Lit>            add_tmp;
+
+    //Logging
+    uint learnt_clause_group; //the group number of learnt clauses. Incremented at each added learnt clause
+
+    // Main internal methods:
+    //
+    void     insertVarOrder   (Var x);                                                 // Insert a variable in the decision order priority queue.
+    Lit      pickBranchLit    (int polarity_mode);                                     // Return the next decision variable.
+    void     newDecisionLevel ();                                                      // Begins a new decision level.
+    void     uncheckedEnqueue (Lit p, Clause* from = NULL);                            // Enqueue a literal. Assumes value of literal is undefined.
+    bool     enqueue          (Lit p, Clause* from = NULL);                            // Test if fact 'p' contradicts current state, enqueue otherwise.
+    Clause*  propagate        (const bool xor_as_well = true);                         // Perform unit propagation. Returns possibly conflicting clause.
+    Clause*  propagate_xors   (const Lit& p);
+    void     cancelUntil      (int level);                                             // Backtrack until a certain level.
+    void     analyze          (Clause* confl, vec<Lit>& out_learnt, int& out_btlevel); // (bt = backtrack)
+    void     analyzeFinal     (Lit p, vec<Lit>& out_conflict);                         // COULD THIS BE IMPLEMENTED BY THE ORDINARIY "analyze" BY SOME REASONABLE GENERALIZATION?
+    bool     litRedundant     (Lit p, uint32_t abstract_levels);                       // (helper method for 'analyze()')
+    lbool    search           (int nof_conflicts, int nof_learnts);                    // Search for a given number of conflicts.
+    void     reduceDB         ();                                                      // Reduce the set of learnt clauses.
+    template<class T>
+    void     removeSatisfied  (vec<T*>& cs);                                           // Shrink 'cs' to contain only non-satisfied clauses.
+    void     cleanClauses     (vec<XorClause*>& cs);
+    void     cleanClauses     (vec<Clause*>& cs);                                      // Remove TRUE or FALSE variables from the xor clauses and remove the FALSE variables from the normal clauses
+    llbool   handle_conflict  (vec<Lit>& learnt_clause, Clause* confl, int& conflictC);// Handles the conflict clause
+    llbool   new_decision     (int& nof_conflicts, int& nof_learnts, int& conflictC);  // Handles the case when all propagations have been made, and now a decision must be made
+
+    // Maintaining Variable/Clause activity:
+    //
+    void     varDecayActivity ();                      // Decay all variables with the specified factor. Implemented by increasing the 'bump' value instead.
+    void     varBumpActivity  (Var v);                 // Increase a variable with the current 'bump' value.
+    void     claDecayActivity ();                      // Decay all clauses with the specified factor. Implemented by increasing the 'bump' value instead.
+    void     claBumpActivity  (Clause& c);             // Increase a clause with the current 'bump' value.
+
+    // Operations on clauses:
+    //
+    void     attachClause     (XorClause& c);
+    void     attachClause     (Clause& c);             // Attach a clause to watcher lists.
+    void     detachClause     (const XorClause& c);
+    void     detachClause     (const Clause& c);       // Detach a clause to watcher lists.
+    template<class T>
+    void     removeClause(T& c);                       // Detach and free a clause.
+    bool     locked           (const Clause& c) const; // Returns TRUE if a clause is a reason for some implication in the current state.
+    bool     satisfied        (const XorClause& c) const; // Returns TRUE if the clause is satisfied in the current state
+    bool     satisfied        (const Clause& c) const; // Returns TRUE if the clause is satisfied in the current state.
+
+    // Misc:
+    //
+    int      decisionLevel    ()      const; // Gives the current decisionlevel.
+    uint32_t abstractLevel    (const Var& x) const; // Used to represent an abstraction of sets of decision levels.
+    double   progressEstimate ()      const; // DELETE THIS ?? IT'S NOT VERY USEFUL ...
+
+    // Debug:
+    void     printLit         (const Lit l) const;
+    void     printClause      (const Clause& c) const;
+    void     printClause      (const XorClause& c) const;
+    void     verifyModel      ();
+    void     checkLiteralCount();
+};
+
+
+//=================================================================================================
+// Implementation of inline methods:
+
+
+inline void Solver::insertVarOrder(Var x)
+{
+    if (!order_heap.inHeap(x) && decision_var[x]) order_heap.insert(x);
+}
+
+inline void Solver::varDecayActivity()
+{
+    var_inc *= var_decay;
+}
+inline void Solver::varBumpActivity(Var v)
+{
+    if ( (activity[v] += var_inc) > 1e100 ) {
+        // Rescale:
+        for (int i = 0; i < nVars(); i++)
+            activity[i] *= 1e-100;
+        var_inc *= 1e-100;
+    }
+
+    // Update order_heap with respect to new activity:
+    if (order_heap.inHeap(v))
+        order_heap.decrease(v);
+}
+
+inline void Solver::claDecayActivity()
+{
+    cla_inc *= clause_decay;
+}
+inline void Solver::claBumpActivity (Clause& c)
+{
+    if ( (c.activity() += cla_inc) > 1e20 ) {
+        // Rescale:
+        for (int i = 0; i < learnts.size(); i++)
+            learnts[i]->activity() *= 1e-20;
+        cla_inc *= 1e-20;
+    }
+}
+
+inline bool     Solver::enqueue         (Lit p, Clause* from)
+{
+    return value(p) != l_Undef ? value(p) != l_False : (uncheckedEnqueue(p, from), true);
+}
+inline bool     Solver::locked          (const Clause& c) const
+{
+    return reason[c[0].var()] == &c && value(c[0]) == l_True;
+}
+inline void     Solver::newDecisionLevel()
+{
+    trail_lim.push(trail.size());
+    #ifdef VERBOSE_DEBUG
+    std::cout << "New decision level:" << trail_lim.size() << std::endl;
+    #endif
+}
+inline int      Solver::decisionLevel ()      const
+{
+    return trail_lim.size();
+}
+inline uint32_t Solver::abstractLevel (const Var& x) const
+{
+    return 1 << (level[x] & 31);
+}
+inline lbool    Solver::value         (const Var& x) const
+{
+    return assigns[x];
+}
+inline lbool    Solver::value         (const Lit& p) const
+{
+    return assigns[p.var()] ^ p.sign();
+}
+inline lbool    Solver::modelValue    (const Lit& p) const
+{
+    return model[p.var()] ^ p.sign();
+}
+inline int      Solver::nAssigns      ()      const
+{
+    return trail.size();
+}
+inline int      Solver::nClauses      ()      const
+{
+    return clauses.size() + xorclauses.size();
+}
+inline int      Solver::nLearnts      ()      const
+{
+    return learnts.size();
+}
+inline int      Solver::nVars         ()      const
+{
+    return assigns.size();
+}
+inline void     Solver::setPolarity   (Var v, bool b)
+{
+    polarity    [v] = (char)b;
+}
+inline void     Solver::setDecisionVar(Var v, bool b)
+{
+    decision_var[v] = (char)b;
+    if (b) {
+        insertVarOrder(v);
+    }
+}
+inline lbool     Solver::solve         ()
+{
+    vec<Lit> tmp;
+    return solve(tmp);
+}
+inline bool     Solver::okay          ()      const
+{
+    return ok;
+}
+inline void     Solver::setSeed (const uint32_t seed)
+{
+    mtrand.seed(seed);    // Set seed of the variable-selection and clause-permutation(if applicable)
+}
+inline void     Solver::needStats()
+{
+    dynamic_behaviour_analysis = true;    // Sets the solver and the logger up to generate statistics
+    logger.statistics_on = true;
+}
+inline void     Solver::needProofGraph()
+{
+    dynamic_behaviour_analysis = true;    // Sets the solver and the logger up to generate proof graphs during solving
+    logger.proof_graph_on = true;
+}
+inline void     Solver::setVariableName(int var, const char* name)
+{
+    while (var >= nVars()) newVar();
+    logger.set_variable_name(var, name);
+} // Sets the varible 'var'-s name to 'name' in the logger
+inline void     Solver::startClauseAdding()
+{
+    if (dynamic_behaviour_analysis) logger.begin();    // Needs to be called before adding any clause
+}
+inline void     Solver::endFirstSimplify()
+{
+    if (dynamic_behaviour_analysis) logger.end(Logger::done_adding_clauses);    // Needs to be called before adding any clause
+}
+inline void     Solver::needRealUnknowns()
+{
+    useRealUnknowns = true;
+}
+
+
+//=================================================================================================
+// Debug + etc:
+
+static inline void logLit(FILE* f, Lit l)
+{
+    fprintf(f, "%sx%d", l.sign() ? "~" : "", l.var()+1);
+}
+
+static inline void logLits(FILE* f, const vec<Lit>& ls)
+{
+    fprintf(f, "[ ");
+    if (ls.size() > 0) {
+        logLit(f, ls[0]);
+        for (int i = 1; i < ls.size(); i++) {
+            fprintf(f, ", ");
+            logLit(f, ls[i]);
+        }
+    }
+    fprintf(f, "] ");
+}
+
+static inline const char* showBool(bool b)
+{
+    return b ? "true" : "false";
+}
+
+
+// Just like 'assert()' but expression will be evaluated in the release version as well.
+static inline void check(bool expr)
+{
+    assert(expr);
+}
+
+};
+
+//=================================================================================================
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/SolverTypes.h b/src/sat/cryptominisat/SolverTypes.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7031e8c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,166 @@
+/***********************************************************************************[SolverTypes.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+#ifndef SolverTypes_h
+#define SolverTypes_h
+
+#include <cassert>
+#include <stdint.h>
+#include "mtl/Alg.h"
+
+
+namespace MINISAT
+{
+//=================================================================================================
+// Variables, literals, lifted booleans, clauses:
+
+
+// NOTE! Variables are just integers. No abstraction here. They should be chosen from 0..N,
+// so that they can be used as array indices.
+
+typedef uint32_t Var;
+#define var_Undef (0xffffffffU >>1)
+
+class Lit
+{
+    uint32_t     x;
+    explicit Lit(uint32_t i) : x(i) { };
+public:
+    Lit() : x(2*var_Undef) {}   // (lit_Undef)
+    explicit Lit(Var var, bool sign) : x((var+var) + (int)sign) { }
+
+    const uint32_t& toInt() const { // Guarantees small, positive integers suitable for array indexing.
+        return x;
+    }
+    Lit  operator~() const {
+        return Lit(x ^ 1);
+    }
+    Lit  operator^(const bool b) const {
+        return Lit(x ^ b);
+    }
+    Lit& operator^=(const bool b) {
+        x ^= b;
+        return *this;
+    }
+    bool sign() const {
+        return x & 1;
+    }
+    Var  var() const {
+        return x >> 1;
+    }
+    Lit  unsign() const {
+        return Lit(x & ~1);
+    }
+    bool operator==(const Lit& p) const {
+        return x == p.x;
+    }
+    bool operator!= (const Lit& p) const {
+        return x != p.x;
+    }
+    bool operator <  (const Lit& p) const {
+        return x < p.x;     // '<' guarantees that p, ~p are adjacent in the ordering.
+    }
+};    
+
+const Lit lit_Undef(var_Undef, false);  // }- Useful special constants.
+const Lit lit_Error(var_Undef, true );  // }
+
+//=================================================================================================
+// Lifted booleans:
+
+class llbool;
+
+class lbool
+{
+    char     value;
+    explicit lbool(char v) : value(v) { }
+
+public:
+    lbool()       : value(0) { };
+    inline char getchar() const {
+        return value;
+    }
+    inline lbool(llbool b);
+
+    inline const bool isUndef() const {
+        return !value;
+    }
+    inline const bool isDef() const {
+        return value;
+    }
+    inline const bool getBool() const {
+        return (value+1) >> 1;
+    }
+    inline const bool operator==(lbool b) const {
+        return value == b.value;
+    }
+    inline const bool operator!=(lbool b) const {
+        return value != b.value;
+    }
+    lbool operator^(const bool b) const {
+        return lbool(value - value*2*b);
+    }
+    //lbool operator ^ (const bool b) const { return b ? lbool(-value) : lbool(value); }
+
+    friend lbool toLbool(const char v);
+    friend lbool boolToLBool(const bool b);
+    friend class llbool;
+};
+inline lbool toLbool(const char   v)
+{
+    return lbool(v);
+}
+inline lbool boolToLBool(const bool b)
+{
+    return lbool(2*b-1);
+}
+
+const lbool l_True  = toLbool( 1);
+const lbool l_False = toLbool(-1);
+const lbool l_Undef = toLbool( 0);
+
+
+class llbool
+{
+    char value;
+
+public:
+    llbool(): value(0) {};
+    llbool(lbool v) :
+            value(v.value) {};
+    llbool(char a) :
+            value(a) {}
+
+    inline const bool operator!=(const llbool& v) const {
+        return (v.value != value);
+    }
+
+    inline const bool operator==(const llbool& v) const {
+        return (v.value == value);
+    }
+
+    friend class lbool;
+};
+const llbool l_Nothing  = toLbool(2);
+const llbool l_Continue = toLbool(3);
+
+lbool::lbool(llbool b) : value(b.value) {};
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/clause.cpp b/src/sat/cryptominisat/clause.cpp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..23a699e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,47 @@
+/***********************************************************************************[SolverTypes.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#include "clause.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+Clause* Clause_new(const vec<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt)
+{
+    void* mem = malloc(sizeof(Clause) + sizeof(Lit)*(ps.size()));
+    Clause* real= new (mem) Clause(ps, group, learnt);
+    return real;
+}
+
+Clause* Clause_new(const vector<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt)
+{
+    void* mem = malloc(sizeof(Clause) + sizeof(Lit)*(ps.size()));
+    Clause* real= new (mem) Clause(ps, group, learnt);
+    return real;
+}
+
+#ifdef USE_GAUSS
+Clause* Clause_new(const mpz_class& ps, const vec<lbool>& assigns, const vector<uint>& col_to_var_original, const uint group, const bool learnt)
+{
+    void* mem = malloc(sizeof(Clause) + sizeof(Lit)*(ps.size()));
+    Clause* real= new (mem) Clause(ps, assigns, col_to_var_original, group, learnt);
+    return real;
+}
+#endif
+}
diff --git a/src/sat/cryptominisat/clause.h b/src/sat/cryptominisat/clause.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c7abb7b
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,160 @@
+/***********************************************************************************[SolverTypes.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+CryptoMiniSat -- Copyright (c) 2009 Mate Soos
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef __clause_h__
+#define __clause_h__
+
+#include <stdint.h>
+#include <cstdio>
+#include <vector>
+#include <sys/types.h>
+#include "mtl/Vec.h"
+#include "SolverTypes.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+#ifndef uint
+#define uint unsigned int
+#endif
+
+using std::vector;
+
+
+//=================================================================================================
+// Clause -- a simple class for representing a clause:
+
+
+class Clause
+{
+public:
+    const uint group;
+protected:
+    uint32_t size_etc;
+    float act;
+    Lit     data[0];
+
+public:
+    Clause(const vec<Lit>& ps, const uint _group, const bool learnt) :
+            group(_group) {
+        size_etc = (ps.size() << 4) | (uint32_t)learnt ;
+        for (int i = 0; i < ps.size(); i++) data[i] = ps[i];
+        if (learnt) act = 0;
+    }
+
+    Clause(const vector<Lit>& ps, const uint _group, const bool learnt) :
+            group(_group) {
+        size_etc = (ps.size() << 4) | (uint32_t)learnt ;
+        for (uint i = 0; i < ps.size(); i++) data[i] = ps[i];
+        if (learnt) act = 0;
+    }
+
+    // -- use this function instead:
+    friend Clause* Clause_new(const vec<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt = false);
+    friend Clause* Clause_new(const vector<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt = false);
+
+    uint         size        ()      const {
+        return size_etc >> 4;
+    }
+    void         shrink      (uint i) {
+        assert(i <= size());
+        size_etc = (((size_etc >> 4) - i) << 4) | (size_etc & 15);
+    }
+    void         pop         () {
+        shrink(1);
+    }
+    bool         learnt      ()      const {
+        return size_etc & 1;
+    }
+    uint32_t     mark        ()      const {
+        return (size_etc >> 1) & 3;
+    }
+    void         mark        (uint32_t m) {
+        size_etc = (size_etc & ~6) | ((m & 3) << 1);
+    }
+
+    Lit&         operator [] (uint32_t i) {
+        return data[i];
+    }
+    const Lit&   operator [] (uint32_t i) const {
+        return data[i];
+    }
+
+    float&       activity    () {
+        return act;
+    }
+
+    Lit*        getData     () {
+        return data;
+    }
+    void print() {
+        Clause& c = *this;
+        printf("group: %d, size: %d, learnt:%d, lits:\"", c.group, c.size(), c.learnt());
+        for (uint i = 0; i < c.size(); i++) {
+            if (c[i].sign())  printf("-");
+            printf("%d ", c[i].var());
+        }
+        printf("\"\n");
+    }
+};
+
+class XorClause : public Clause
+{
+public:
+    // NOTE: This constructor cannot be used directly (doesn't allocate enough memory).
+    template<class V>
+    XorClause(const V& ps, const bool _xor_clause_inverted, const uint _group, const bool learnt) :
+            Clause(ps, _group, learnt) {
+        size_etc |= (((uint32_t)_xor_clause_inverted) << 3);
+    }
+
+    // -- use this function instead:
+    template<class V>
+    friend XorClause* XorClause_new(const V& ps, const bool xor_clause_inverted, const uint group, const bool learnt = false) {
+        void* mem = malloc(sizeof(XorClause) + sizeof(Lit)*(ps.size()));
+        XorClause* real= new (mem) XorClause(ps, xor_clause_inverted, group, learnt);
+        return real;
+    }
+
+    inline bool         xor_clause_inverted() const {
+        return size_etc & 8;
+    }
+    inline void         invert      (bool b) {
+        size_etc ^= (uint32_t)b << 3;
+    }
+
+    void print() {
+        Clause& c = *this;
+        printf("group: %d, size: %d, learnt:%d, lits:\"", c.group, c.size(), c.learnt());
+        for (uint i = 0; i < c.size();) {
+            assert(!c[i].sign());
+            printf("%d", c[i].var());
+            i++;
+            if (i < c.size()) printf(" + ");
+        }
+        printf("\"\n");
+    }
+};
+
+Clause* Clause_new(const vec<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt);
+Clause* Clause_new(const vector<Lit>& ps, const uint group, const bool learnt);
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/fcopy.cpp b/src/sat/cryptominisat/fcopy.cpp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..79fd312
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,51 @@
+
+#include <stdio.h>
+#include <string.h>
+#include "fcopy.h"
+
+
+namespace MINISAT
+{
+#define BUFSZ 16000
+
+int FileCopy ( const char *src, const char *dst )
+{
+    char            *buf;
+    FILE            *fi;
+    FILE            *fo;
+    unsigned        amount;
+    unsigned        written;
+    int             result;
+
+    buf = new char[BUFSZ];
+
+    fi = fopen( src, "rb" );
+    fo = fopen( dst, "wb" );
+
+    result = COPY_OK;
+    if  ((fi == NULL) || (fo == NULL) ) {
+        result = COPY_ERROR;
+        if (fi != NULL) fclose(fi);
+        if (fo != NULL) fclose(fo);
+    }
+
+    if (result == COPY_OK) {
+        do {
+            amount = fread( buf, sizeof(char), BUFSZ, fi );
+            if (amount) {
+                written = fwrite( buf, sizeof(char), amount, fo );
+                if (written != amount)
+                    result = COPY_ERROR; // out of disk space or some other disk err?
+            }
+        } // when amount read is < BUFSZ, copy
+        while ((result == COPY_OK) && (amount == BUFSZ));
+        fclose(fi);
+        fclose(fo);
+    }
+
+    delete[] buf;
+
+    return(result);
+}
+
+};
diff --git a/src/sat/cryptominisat/fcopy.h b/src/sat/cryptominisat/fcopy.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a1958eb
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,14 @@
+#ifndef __FCOPY_H__
+#define __FCOPY_H__
+
+namespace MINISAT
+{
+
+#define COPY_ERROR      -1
+#define COPY_OK          0
+
+int FileCopy( const char *src, const char *dst );
+
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Alg.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Alg.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..58fc50a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,62 @@
+/*******************************************************************************************[Alg.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Alg_h
+#define Alg_h
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// Useful functions on vectors
+
+
+#if 1
+template<class V, class T>
+static inline void remove(V& ts, const T& t)
+{
+    int j = 0;
+    for (; j < ts.size() && ts[j] != t; j++);
+    assert(j < ts.size());
+    for (; j < ts.size()-1; j++) ts[j] = ts[j+1];
+    ts.pop();
+}
+#else
+template<class V, class T>
+static inline void remove(V& ts, const T& t)
+{
+    int j = 0;
+    for (; j < ts.size() && ts[j] != t; j++);
+    assert(j < ts.size());
+    ts[j] = ts.last();
+    ts.pop();
+}
+#endif
+
+template<class V, class T>
+static inline bool find(V& ts, const T& t)
+{
+    int j = 0;
+    for (; j < ts.size() && ts[j] != t; j++);
+    return j < ts.size();
+}
+
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/BasicHeap.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/BasicHeap.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4a34e77
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,102 @@
+/******************************************************************************************[Heap.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef BasicHeap_h
+#define BasicHeap_h
+#include "Vec.h"
+
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// A heap implementation with support for decrease/increase key.
+
+
+template<class Comp>
+class BasicHeap {
+    Comp     lt;
+    vec<int> heap;     // heap of ints
+
+    // Index "traversal" functions
+    static inline int left  (int i) { return i*2+1; }
+    static inline int right (int i) { return (i+1)*2; }
+    static inline int parent(int i) { return (i-1) >> 1; }
+
+    inline void percolateUp(int i)
+    {
+        int x = heap[i];
+        while (i != 0 && lt(x, heap[parent(i)])){
+            heap[i]          = heap[parent(i)];
+            i                = parent(i);
+        }
+        heap   [i] = x;
+    }
+
+
+    inline void percolateDown(int i)
+    {
+        int x = heap[i];
+        while (left(i) < heap.size()){
+            int child = right(i) < heap.size() && lt(heap[right(i)], heap[left(i)]) ? right(i) : left(i);
+            if (!lt(heap[child], x)) break;
+            heap[i]          = heap[child];
+            i                = child;
+        }
+        heap[i] = x;
+    }
+
+
+    bool heapProperty(int i) {
+        return i >= heap.size()
+            || ((i == 0 || !lt(heap[i], heap[parent(i)])) && heapProperty(left(i)) && heapProperty(right(i))); }
+
+
+  public:
+    BasicHeap(const C& c) : comp(c) { }
+
+    int  size      ()                     const { return heap.size(); }
+    bool empty     ()                     const { return heap.size() == 0; }
+    int  operator[](int index)            const { return heap[index+1]; }
+    void clear     (bool dealloc = false)       { heap.clear(dealloc); }
+    void insert    (int n)                      { heap.push(n); percolateUp(heap.size()-1); }
+
+
+    int  removeMin() {
+        int r   = heap[0];
+        heap[0] = heap.last();
+        heap.pop();
+        if (heap.size() > 1) percolateDown(0);
+        return r; 
+    }
+
+
+    // DEBUG: consistency checking
+    bool heapProperty() {
+        return heapProperty(1); }
+
+
+    // COMPAT: should be removed
+    int  getmin    ()      { return removeMin(); }
+};
+
+};
+
+//=================================================================================================
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/BoxedVec.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/BoxedVec.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3178856
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,151 @@
+/*******************************************************************************************[Vec.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef BoxedVec_h
+#define BoxedVec_h
+
+#include <cstdlib>
+#include <cassert>
+#include <new>
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// Automatically resizable arrays
+//
+// NOTE! Don't use this vector on datatypes that cannot be re-located in memory (with realloc)
+
+template<class T>
+class bvec {
+
+    static inline int imin(int x, int y) {
+        int mask = (x-y) >> (sizeof(int)*8-1);
+        return (x&mask) + (y&(~mask)); }
+
+    static inline int imax(int x, int y) {
+        int mask = (y-x) >> (sizeof(int)*8-1);
+        return (x&mask) + (y&(~mask)); }
+
+    struct Vec_t {
+        int sz;
+        int cap;
+        T   data[0];
+
+        static Vec_t* alloc(Vec_t* x, int size){
+            x = (Vec_t*)realloc((void*)x, sizeof(Vec_t) + sizeof(T)*size);
+            x->cap = size;
+            return x;
+        }
+        
+    };
+
+    Vec_t* ref;
+
+    static const int init_size = 2;
+    static int   nextSize (int current) { return (current * 3 + 1) >> 1; }
+    static int   fitSize  (int needed)  { int x; for (x = init_size; needed > x; x = nextSize(x)); return x; }
+
+    void fill (int size) {
+        assert(ref != NULL);
+        for (T* i = ref->data; i < ref->data + size; i++)
+            new (i) T();
+    }
+
+    void fill (int size, const T& pad) {
+        assert(ref != NULL);
+        for (T* i = ref->data; i < ref->data + size; i++)
+            new (i) T(pad);
+    }
+
+    // Don't allow copying (error prone):
+    altvec<T>&  operator = (altvec<T>& other) { assert(0); }
+    altvec (altvec<T>& other)                  { assert(0); }
+
+public:
+    void     clear  (bool dealloc = false) { 
+        if (ref != NULL){
+            for (int i = 0; i < ref->sz; i++) 
+                (*ref).data[i].~T();
+
+            if (dealloc) { 
+                free(ref); ref = NULL; 
+            }else 
+                ref->sz = 0;
+        } 
+    }
+
+    // Constructors:
+    altvec(void)                   : ref (NULL) { }
+    altvec(int size)               : ref (Vec_t::alloc(NULL, fitSize(size))) { fill(size);      ref->sz = size; }
+    altvec(int size, const T& pad) : ref (Vec_t::alloc(NULL, fitSize(size))) { fill(size, pad); ref->sz = size; }
+   ~altvec(void) { clear(true); }
+
+    // Ownership of underlying array:
+    operator T*       (void)           { return ref->data; }     // (unsafe but convenient)
+    operator const T* (void) const     { return ref->data; }
+
+    // Size operations:
+    int      size   (void) const       { return ref != NULL ? ref->sz : 0; }
+
+    void     pop    (void)             { assert(ref != NULL && ref->sz > 0); int last = --ref->sz; ref->data[last].~T(); }
+    void     push   (const T& elem) {
+        int size = ref != NULL ? ref->sz  : 0;
+        int cap  = ref != NULL ? ref->cap : 0;
+        if (size == cap){
+            cap = cap != 0 ? nextSize(cap) : init_size;
+            ref = Vec_t::alloc(ref, cap); 
+        }
+        //new (&ref->data[size]) T(elem); 
+        ref->data[size] = elem; 
+        ref->sz = size+1; 
+    }
+
+    void     push   () {
+        int size = ref != NULL ? ref->sz  : 0;
+        int cap  = ref != NULL ? ref->cap : 0;
+        if (size == cap){
+            cap = cap != 0 ? nextSize(cap) : init_size;
+            ref = Vec_t::alloc(ref, cap); 
+        }
+        new (&ref->data[size]) T(); 
+        ref->sz = size+1; 
+    }
+
+    void     shrink (int nelems)             { for (int i = 0; i < nelems; i++) pop(); }
+    void     shrink_(int nelems)             { for (int i = 0; i < nelems; i++) pop(); }
+    void     growTo (int size)               { while (this->size() < size) push(); }
+    void     growTo (int size, const T& pad) { while (this->size() < size) push(pad); }
+    void     capacity (int size)             { growTo(size); }
+
+    const T& last  (void) const              { return ref->data[ref->sz-1]; }
+    T&       last  (void)                    { return ref->data[ref->sz-1]; }
+
+    // Vector interface:
+    const T& operator [] (int index) const  { return ref->data[index]; }
+    T&       operator [] (int index)        { return ref->data[index]; }
+
+    void copyTo(altvec<T>& copy) const { copy.clear(); for (int i = 0; i < size(); i++) copy.push(ref->data[i]); }
+    void moveTo(altvec<T>& dest) { dest.clear(true); dest.ref = ref; ref = NULL; }
+
+};
+
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Heap.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Heap.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6647a94
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,173 @@
+/******************************************************************************************[Heap.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Heap_h
+#define Heap_h
+
+#include "Vec.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// A heap implementation with support for decrease/increase key.
+
+
+template<class Comp>
+class Heap {
+    Comp     lt;
+    vec<int> heap;     // heap of ints
+    vec<int> indices;  // int -> index in heap
+
+    // Index "traversal" functions
+    static inline int left  (int i) { return i*2+1; }
+    static inline int right (int i) { return (i+1)*2; }
+    static inline int parent(int i) { return (i-1) >> 1; }
+
+
+    inline void percolateUp(int i)
+    {
+        int x = heap[i];
+        while (i != 0 && lt(x, heap[parent(i)])){
+            heap[i]          = heap[parent(i)];
+            indices[heap[i]] = i;
+            i                = parent(i);
+        }
+        heap   [i] = x;
+        indices[x] = i;
+    }
+
+
+    inline void percolateDown(int i)
+    {
+        int x = heap[i];
+        while (left(i) < heap.size()){
+            int child = right(i) < heap.size() && lt(heap[right(i)], heap[left(i)]) ? right(i) : left(i);
+            if (!lt(heap[child], x)) break;
+            heap[i]          = heap[child];
+            indices[heap[i]] = i;
+            i                = child;
+        }
+        heap   [i] = x;
+        indices[x] = i;
+    }
+
+
+    bool heapProperty (int i) const {
+        return i >= heap.size()
+            || ((i == 0 || !lt(heap[i], heap[parent(i)])) && heapProperty(left(i)) && heapProperty(right(i))); }
+
+
+  public:
+    Heap(const Comp& c) : lt(c) { }
+
+    int  size      ()          const { return heap.size(); }
+    bool empty     ()          const { return heap.size() == 0; }
+    bool inHeap    (int n)     const { return n < indices.size() && indices[n] >= 0; }
+    int  operator[](int index) const { assert(index < heap.size()); return heap[index]; }
+
+    void decrease  (int n) { assert(inHeap(n)); percolateUp(indices[n]); }
+
+    // RENAME WHEN THE DEPRECATED INCREASE IS REMOVED.
+    void increase_ (int n) { assert(inHeap(n)); percolateDown(indices[n]); }
+
+
+    void insert(int n)
+    {
+        indices.growTo(n+1, -1);
+        assert(!inHeap(n));
+
+        indices[n] = heap.size();
+        heap.push(n);
+        percolateUp(indices[n]); 
+    }
+
+
+    int  removeMin()
+    {
+        int x            = heap[0];
+        heap[0]          = heap.last();
+        indices[heap[0]] = 0;
+        indices[x]       = -1;
+        heap.pop();
+        if (heap.size() > 1) percolateDown(0);
+        return x; 
+    }
+
+
+    void clear(bool dealloc = false) 
+    { 
+        for (int i = 0; i < heap.size(); i++)
+            indices[heap[i]] = -1;
+#ifdef NDEBUG
+        for (int i = 0; i < indices.size(); i++)
+            assert(indices[i] == -1);
+#endif
+        heap.clear(dealloc); 
+    }
+
+
+    // Fool proof variant of insert/decrease/increase
+    void update (int n)
+    {
+        if (!inHeap(n))
+            insert(n);
+        else {
+            percolateUp(indices[n]);
+            percolateDown(indices[n]);
+        }
+    }
+
+
+    // Delete elements from the heap using a given filter function (-object).
+    // *** this could probaly be replaced with a more general "buildHeap(vec<int>&)" method ***
+    template <class F>
+    void filter(const F& filt) {
+        int i,j;
+        for (i = j = 0; i < heap.size(); i++)
+            if (filt(heap[i])){
+                heap[j]          = heap[i];
+                indices[heap[i]] = j++;
+            }else
+                indices[heap[i]] = -1;
+
+        heap.shrink(i - j);
+        for (int i = heap.size() / 2 - 1; i >= 0; i--)
+            percolateDown(i);
+
+        assert(heapProperty());
+    }
+
+
+    // DEBUG: consistency checking
+    bool heapProperty() const {
+        return heapProperty(1); }
+
+
+    // COMPAT: should be removed
+    void setBounds (int n) { }
+    void increase  (int n) { decrease(n); }
+    int  getmin    ()      { return removeMin(); }
+
+};
+
+};
+
+//=================================================================================================
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Map.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Map.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..302069a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,122 @@
+/*******************************************************************************************[Map.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Map_h
+#define Map_h
+
+#include <stdint.h>
+#include "Vec.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+// Default hash/equals functions
+//
+
+template<class K> struct Hash  { uint32_t operator()(const K& k)               const { return hash(k);  } };
+template<class K> struct Equal { bool     operator()(const K& k1, const K& k2) const { return k1 == k2; } };
+
+template<class K> struct DeepHash  { uint32_t operator()(const K* k)               const { return hash(*k);  } };
+template<class K> struct DeepEqual { bool     operator()(const K* k1, const K* k2) const { return *k1 == *k2; } };
+
+//=================================================================================================
+// Some primes
+//
+
+static const int nprimes          = 25;
+static const int primes [nprimes] = { 31, 73, 151, 313, 643, 1291, 2593, 5233, 10501, 21013, 42073, 84181, 168451, 337219, 674701, 1349473, 2699299, 5398891, 10798093, 21596719, 43193641, 86387383, 172775299, 345550609, 691101253 };
+
+//=================================================================================================
+// Hash table implementation of Maps
+//
+
+template<class K, class D, class H = Hash<K>, class E = Equal<K> >
+class Map {
+    struct Pair { K key; D data; };
+
+    H          hash;
+    E          equals;
+
+    vec<Pair>* table;
+    int        cap;
+    int        size;
+
+    // Don't allow copying (error prone):
+    Map<K,D,H,E>&  operator = (Map<K,D,H,E>& other) { assert(0); }
+                   Map        (Map<K,D,H,E>& other) { assert(0); }
+
+    int32_t index  (const K& k) const { return hash(k) % cap; }
+    void   _insert (const K& k, const D& d) { table[index(k)].push(); table[index(k)].last().key = k; table[index(k)].last().data = d; }
+    void    rehash () {
+        const vec<Pair>* old = table;
+
+        int newsize = primes[0];
+        for (int i = 1; newsize <= cap && i < nprimes; i++)
+           newsize = primes[i];
+
+        table = new vec<Pair>[newsize];
+
+        for (int i = 0; i < cap; i++){
+            for (int j = 0; j < old[i].size(); j++){
+                _insert(old[i][j].key, old[i][j].data); }}
+
+        delete [] old;
+
+        cap = newsize;
+    }
+
+    
+    public:
+
+     Map () : table(NULL), cap(0), size(0) {}
+     Map (const H& h, const E& e) : Map(), hash(h), equals(e) {}
+    ~Map () { delete [] table; }
+
+    void insert (const K& k, const D& d) { if (size+1 > cap / 2) rehash(); _insert(k, d); size++; }
+    bool peek   (const K& k, D& d) {
+        if (size == 0) return false;
+        const vec<Pair>& ps = table[index(k)];
+        for (int i = 0; i < ps.size(); i++)
+            if (equals(ps[i].key, k)){
+                d = ps[i].data;
+                return true; } 
+        return false;
+    }
+
+    void remove (const K& k) {
+        assert(table != NULL);
+        vec<Pair>& ps = table[index(k)];
+        int j = 0;
+        for (; j < ps.size() && !equals(ps[j].key, k); j++);
+        assert(j < ps.size());
+        ps[j] = ps.last();
+        ps.pop();
+    }
+
+    void clear  () {
+        cap = size = 0;
+        delete [] table;
+        table = NULL;
+    }
+};
+
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Queue.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Queue.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..52f8fb2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,87 @@
+/*****************************************************************************************[Queue.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Queue_h
+#define Queue_h
+
+#include "Vec.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+
+//=================================================================================================
+
+
+template <class T>
+class Queue {
+    vec<T>  elems;
+    int     first;
+
+public:
+    Queue(void) : first(0) { }
+
+    void insert(T x)   { elems.push(x); }
+    T    peek  () const { return elems[first]; }
+    void pop   () { first++; }
+
+    void clear(bool dealloc = false)   { elems.clear(dealloc); first = 0; }
+    int  size(void)    { return elems.size() - first; }
+
+    //bool has(T x) { for (int i = first; i < elems.size(); i++) if (elems[i] == x) return true; return false; }
+
+    const T& operator [] (int index) const  { return elems[first + index]; }
+
+};
+
+//template<class T>
+//class Queue {
+//    vec<T>  buf;
+//    int     first;
+//    int     end;
+//
+//public:
+//    typedef T Key;
+//
+//    Queue() : buf(1), first(0), end(0) {}
+//
+//    void clear () { buf.shrinkTo(1); first = end = 0; }
+//    int  size  () { return (end >= first) ? end - first : end - first + buf.size(); }
+//
+//    T    peek  () { assert(first != end); return buf[first]; }
+//    void pop   () { assert(first != end); first++; if (first == buf.size()) first = 0; }
+//    void insert(T elem) {   // INVARIANT: buf[end] is always unused
+//        buf[end++] = elem;
+//        if (end == buf.size()) end = 0;
+//        if (first == end){  // Resize:
+//            vec<T>  tmp((buf.size()*3 + 1) >> 1);
+//            //**/printf("queue alloc: %d elems (%.1f MB)\n", tmp.size(), tmp.size() * sizeof(T) / 1000000.0);
+//            int     i = 0;
+//            for (int j = first; j < buf.size(); j++) tmp[i++] = buf[j];
+//            for (int j = 0    ; j < end       ; j++) tmp[i++] = buf[j];
+//            first = 0;
+//            end   = buf.size();
+//            tmp.moveTo(buf);
+//        }
+//    }
+//};
+
+};
+
+//=================================================================================================
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Sort.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Sort.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..76f168f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,94 @@
+/******************************************************************************************[Sort.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Sort_h
+#define Sort_h
+#include "Vec.h"
+
+namespace MINISAT
+{
+//=================================================================================================
+// Some sorting algorithms for vec's
+
+
+template<class T>
+struct LessThan_default {
+    bool operator () (T x, T y) { return x < y; }
+};
+
+
+template <class T, class LessThan>
+void selectionSort(T* array, int size, LessThan lt)
+{
+    int     i, j, best_i;
+    T       tmp;
+
+    for (i = 0; i < size-1; i++){
+        best_i = i;
+        for (j = i+1; j < size; j++){
+            if (lt(array[j], array[best_i]))
+                best_i = j;
+        }
+        tmp = array[i]; array[i] = array[best_i]; array[best_i] = tmp;
+    }
+}
+template <class T> static inline void selectionSort(T* array, int size) {
+    selectionSort(array, size, LessThan_default<T>()); }
+
+template <class T, class LessThan>
+void sort(T* array, int size, LessThan lt)
+{
+    if (size <= 15)
+        selectionSort(array, size, lt);
+
+    else{
+        T           pivot = array[size / 2];
+        T           tmp;
+        int         i = -1;
+        int         j = size;
+
+        for(;;){
+            do i++; while(lt(array[i], pivot));
+            do j--; while(lt(pivot, array[j]));
+
+            if (i >= j) break;
+
+            tmp = array[i]; array[i] = array[j]; array[j] = tmp;
+        }
+
+        sort(array    , i     , lt);
+        sort(&array[i], size-i, lt);
+    }
+}
+template <class T> static inline void sort(T* array, int size) {
+    sort(array, size, LessThan_default<T>()); }
+
+
+//=================================================================================================
+// For 'vec's:
+
+
+template <class T, class LessThan> void sort(vec<T>& v, LessThan lt) {
+    sort(v.getData(), v.size(), lt); }
+template <class T> void sort(vec<T>& v) {
+    sort(v, LessThan_default<T>()); }
+
+};
+//=================================================================================================
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/Vec.h b/src/sat/cryptominisat/mtl/Vec.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..a3c5fca
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,135 @@
+/*******************************************************************************************[Vec.h]
+MiniSat -- Copyright (c) 2003-2006, Niklas Een, Niklas Sorensson
+
+Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy of this software and
+associated documentation files (the "Software"), to deal in the Software without restriction,
+including without limitation the rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute,
+sublicense, and/or sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+furnished to do so, subject to the following conditions:
+
+The above copyright notice and this permission notice shall be included in all copies or
+substantial portions of the Software.
+
+THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR IMPLIED, INCLUDING BUT
+NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY, FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND
+NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM,
+DAMAGES OR OTHER LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM, OUT
+OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE SOFTWARE.
+**************************************************************************************************/
+
+#ifndef Vec_h
+#define Vec_h
+#include <cstdlib>
+#include <cassert>
+#include <new>
+
+namespace MINISAT
+{
+//=================================================================================================
+// Automatically resizable arrays
+//
+// NOTE! Don't use this vector on datatypes that cannot be re-located in memory (with realloc)
+
+template<class T>
+class vec {
+    T*  data;
+    int sz;
+    int cap;
+
+    void     init(int size, const T& pad);
+    void     grow(int min_cap);
+
+    // Don't allow copying (error prone):
+    vec<T>&  operator = (vec<T>& other) { assert(0); return *this; }
+             vec        (vec<T>& other) { assert(0); }
+
+    static inline int imin(int x, int y) {
+        int mask = (x-y) >> (sizeof(int)*8-1);
+        return (x&mask) + (y&(~mask)); }
+
+    static inline int imax(int x, int y) {
+        int mask = (y-x) >> (sizeof(int)*8-1);
+        return (x&mask) + (y&(~mask)); }
+
+public:
+    // Types:
+    typedef int Key;
+    typedef T   Datum;
+
+    // Constructors:
+    vec(void)                   : data(NULL) , sz(0)   , cap(0)    { }
+    vec(int size)               : data(NULL) , sz(0)   , cap(0)    { growTo(size); }
+    vec(int size, const T& pad) : data(NULL) , sz(0)   , cap(0)    { growTo(size, pad); }
+    vec(T* array, int size)     : data(array), sz(size), cap(size) { }      // (takes ownership of array -- will be deallocated with 'free()')
+   ~vec(void)                                                      { clear(true); }
+
+    // Ownership of underlying array:
+    T*       release  (void)           { T* ret = data; data = NULL; sz = 0; cap = 0; return ret; }
+    const T* getData() const {return data; }
+    T* getData() {return data; }
+
+    // Size operations:
+    int      size   (void) const       { return sz; }
+    void     shrink (int nelems)       { assert(nelems <= sz); for (int i = 0; i < nelems; i++) sz--, data[sz].~T(); }
+    void     shrink_(int nelems)       { assert(nelems <= sz); sz -= nelems; }
+    void     pop    (void)             { sz--, data[sz].~T(); }
+    void     growTo (int size);
+    void     growTo (int size, const T& pad);
+    void     clear  (bool dealloc = false);
+    void     capacity (int size) { grow(size); }
+
+    // Stack interface:
+#if 1
+    void     push  (void)              { if (sz == cap) { cap = imax(2, (cap*3+1)>>1); data = (T*)realloc(data, cap * sizeof(T)); } new (&data[sz]) T(); sz++; }
+    //void     push  (const T& elem)     { if (sz == cap) { cap = imax(2, (cap*3+1)>>1); data = (T*)realloc(data, cap * sizeof(T)); } new (&data[sz]) T(elem); sz++; }
+    void     push  (const T& elem)     { if (sz == cap) { cap = imax(2, (cap*3+1)>>1); data = (T*)realloc(data, cap * sizeof(T)); } data[sz++] = elem; }
+    void     push_ (const T& elem)     { assert(sz < cap); data[sz++] = elem; }
+#else
+    void     push  (void)              { if (sz == cap) grow(sz+1); new (&data[sz]) T()    ; sz++; }
+    void     push  (const T& elem)     { if (sz == cap) grow(sz+1); new (&data[sz]) T(elem); sz++; }
+#endif
+
+    const T& last  (void) const        { return data[sz-1]; }
+    T&       last  (void)              { return data[sz-1]; }
+
+    // Vector interface:
+    const T& operator [] (int index) const  { return data[index]; }
+    T&       operator [] (int index)        { return data[index]; }
+
+
+    // Duplicatation (preferred instead):
+    void copyTo(vec<T>& copy) const { copy.clear(); copy.growTo(sz); for (int i = 0; i < sz; i++) new (&copy[i]) T(data[i]); }
+    void moveTo(vec<T>& dest) { dest.clear(true); dest.data = data; dest.sz = sz; dest.cap = cap; data = NULL; sz = 0; cap = 0; }
+};
+
+template<class T>
+void vec<T>::grow(int min_cap) {
+    if (min_cap <= cap) return;
+    if (cap == 0) cap = (min_cap >= 2) ? min_cap : 2;
+    else          do cap = (cap*3+1) >> 1; while (cap < min_cap);
+    data = (T*)realloc(data, cap * sizeof(T)); }
+
+template<class T>
+void vec<T>::growTo(int size, const T& pad) {
+    if (sz >= size) return;
+    grow(size);
+    for (int i = sz; i < size; i++) new (&data[i]) T(pad);
+    sz = size; }
+
+template<class T>
+void vec<T>::growTo(int size) {
+    if (sz >= size) return;
+    grow(size);
+    for (int i = sz; i < size; i++) new (&data[i]) T();
+    sz = size; }
+
+template<class T>
+void vec<T>::clear(bool dealloc) {
+    if (data != NULL){
+        for (int i = 0; i < sz; i++) data[i].~T();
+        sz = 0;
+        if (dealloc) free(data), data = NULL, cap = 0; } }
+
+};
+
+#endif
diff --git a/src/sat/cryptominisat/mtl/template.mk b/src/sat/cryptominisat/mtl/template.mk
new file mode 100644 (file)
index 0000000..565498f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,94 @@
+##
+##  Template makefile for Standard, Profile, Debug, Release, and
+##  Release-static versions
+##
+##    eg: "make rs" for a statically linked release version.  "make d"
+##        for a debug version (no optimizations).  "make" for the
+##        standard version (optimized, but with debug information and
+##        assertions active)
+
+CSRCS     ?= $(wildcard *.C *.cpp)
+CHDRS     ?= $(wildcard *.h)
+COBJS     ?= $(addsuffix .o, $(basename $(CSRCS))) 
+
+PCOBJS     = $(addsuffix p,  $(COBJS))
+DCOBJS     = $(addsuffix d,  $(COBJS))
+RCOBJS     = $(addsuffix r,  $(COBJS))
+
+EXEC      ?= $(notdir $(shell pwd))
+LIB       ?= $(EXEC)
+
+CXX       ?= g++
+CFLAGS    ?= -Wall
+LFLAGS    ?= -Wall
+
+COPTIMIZE ?= -O3
+
+.PHONY : s p d r rs lib libd clean 
+
+s:     $(EXEC)
+p:     $(EXEC)_profile
+d:     $(EXEC)_debug
+r:     $(EXEC)_release
+rs:    $(EXEC)_static
+lib:   lib$(LIB).a
+libd:  lib$(LIB)d.a
+libp:  lib$(LIB)p.a
+
+## Compile options
+%.op:                  CFLAGS +=$(COPTIMIZE) -pg -ggdb -D NDEBUG -DEXT_HASH_MAP
+%.od:                  CFLAGS +=-O0 -ggdb -D DEBUG # -D INVARIANTS
+%.o:                   CFLAGS +=$(COPTIMIZE) -D NDEBUG
+
+## Link options
+$(EXEC):               LFLAGS := -ggdb $(LFLAGS)
+$(EXEC)_profile:       LFLAGS := -ggdb -pg $(LFLAGS)
+$(EXEC)_debug:         LFLAGS := -ggdb $(LFLAGS)
+$(EXEC)_release:       LFLAGS := $(LFLAGS)
+$(EXEC)_static:                LFLAGS := --static $(LFLAGS)
+
+## Dependencies
+$(EXEC):               $(COBJS)
+$(EXEC)_profile:       $(PCOBJS)
+$(EXEC)_debug:         $(DCOBJS)
+$(EXEC)_release:       $(RCOBJS)
+$(EXEC)_static:                $(RCOBJS)
+
+lib$(LIB).a:   $(filter-out Main.or, $(COBJS))
+lib$(LIB)d.a:  $(filter-out Main.od, $(DCOBJS))
+lib$(LIB)p.a:  $(filter-out Main.op, $(PCOBJS))
+
+
+## Build rule
+%.o %.op %.od: %.C %.cpp
+       @echo Compiling: "$@ ( $< )"
+       $(CXX) $(CFLAGS) -c -o $@ $<
+
+## Linking rules (standard/profile/debug/release)
+$(EXEC) $(EXEC)_profile $(EXEC)_debug $(EXEC)_release $(EXEC)_static:
+       @echo Linking: "$@ ( $^ )"
+       @$(CXX) $^ $(LFLAGS) -o $@
+
+## Library rule
+lib$(LIB).a lib$(LIB)d.a lib$(LIB)p.a:
+       @echo Library: "$@ ( $^ )"
+       @rm -f $@
+       @ar cq $@ $^    
+
+## Clean rule
+clean:
+       @rm -f *~ $(EXEC) $(EXEC)_profile $(EXEC)_debug $(EXEC)_release $(EXEC)_static \
+       $(COBJS) $(PCOBJS) $(DCOBJS) $(RCOBJS) *.core depend.mk depend.mak lib$(LIB).a \
+       lib$(LIB)d.a lib$(LIB)p.a
+
+## Make dependencies
+depend.mk: $(CSRCS) $(CHDRS)
+       @echo Making dependencies ...
+       @$(CXX) $(CFLAGS) -MM $(CSRCS) > depend.mk
+       @cp depend.mk /tmp/depend.mk.tmp
+       @sed "s/o:/op:/" /tmp/depend.mk.tmp >> depend.mk
+       @sed "s/o:/od:/" /tmp/depend.mk.tmp >> depend.mk
+       @sed "s/o:/or:/" /tmp/depend.mk.tmp >> depend.mk
+       @rm /tmp/depend.mk.tmp
+
+-include depend.mk